中国沿海蛾螺科5属10种的系统学分析

摘要

蛾螺科属于软体动物门(Mollusca)，腹足纲(Gastropoda)，在全世界有数百种。目前已报道在我国分布的蛾螺科种类有13个属，约31个种，但其系统学和一些种类的分类地位仍存在较大的争议。本研究利用核糖体小亚基18S rRNA基因、核糖体大亚基28S rRNA基因及线粒体COI基因的部分序列对我国辽宁、山东、福建沿海蛾螺科内5个属10个种的系统发生进行了分析。通过PCR分别获得了大约1800bp、1400bp和700bp的片段，测序之后，通过遗传分析软件对序列进行了比对分析，利用Neighbor-joining(NJ)法、Minimum evolution(ME)法和Maximum parsimony(MP)法建立了系统树。结果显示，所研究的蛾螺科5属10种可以被分为5个亚群：第一大分支为香螺亚群，包括Neptunea属的香螺、新英格兰蛾螺、Neptunea eulimata Dall、和一个未知种以及Siphonalia妇属的略胀管蛾螺；第二个分支为侧平肩螺亚群；第三个分支为水泡蛾螺和黄海蛾螺亚群；第四个分支为褐管蛾螺亚群；第五个分支为方斑东风螺亚群。由系统学分析可知，香螺是蛾螺科中较为进化的种；未知种为香螺属内的种；略胀管蛾螺与Neptunea属的种类亲缘关系较近，建议将略胀管蛾螺归为Neptunea属。

目录

文摘

英文文摘

声明

1前言

1.1腹足纲动物的分类情况

1.2腹足纲系统学研究概况

1.2.1形态学研究

1.2.2细胞学研究

1.2.3分子标记研究

1.2.4分子系统学研究在分类学和进化研究中的局限性与分歧

1.3展望

1.4蛾螺科的概况

1.5本研究进行系统学分析所用的基因特点及应用

1.5.1核糖体基因

1.5.2线粒体基因

1.6本研究的目的和意义

2材料与方法

2.1实验材料及仪器试剂

2.1.1材料采集

2.1.2主要试剂

2.1.3主要仪器

2.2方法

2.2.1总DNA的提取

2.2.2 PCR

2.2.3目的片段的纯化

2.2.4目的片段克隆

2.2.5测序

2.2.6 序列分析

3结果

3.1.总DNA的提取结果

3.2 PCR

3.2.1 18S rRNA基因PCR结果

3.2.2 28S rRNA基因PCR结果

3.2.3 COI基因PCR结果

3.3序列分析

3.3.1 18S rRNA测序比对结果

3.3.2 28S rRNA测序比对结果

3.3.3 COI基因测序比对结果

3.4序列分析

3.4.1 18S rRNA基因序列分析结果

3.4.2 28S rRNA基因序列分析结果

3.4.3 COI基因序列分析结果

4讨论

4.1蛾螺科5属10种的形态学描述

4.2 18S rRNA基因序列分析

4.2.1 18S rRNA基因的序列分析

4.2.2基于18S rRNA基因的系统学分析

4.3 28S rRNA基因序列分析

4.3.1 28S rRNA基因的序列分析

4.3.2基于28S rRNA基因的系统学分析

4.4 COI基因分析

4.4.1 COI基因的序列分析

4.4.2基于COI基因的系统学分析

4.5对三个基因总的系统学分析

5结论

参考文献

致谢

个人简历及论文发表情况