基于线粒体COI和12SrRNA基因的常见肉食螨系统分析

摘要

本论文基于线粒体COⅠ基因、12S rRNA基因对肉食螨亚科常见的3属5种肉食螨(马六甲肉食螨、强壮肉食螨、转开肉食螨、鳞翅触足螨及中华真扇毛螨)的系统关系进行分析,主要研究内容和结果如下:
　　 1、五种肉食螨的COⅠ基因系统分析
　　 对五种肉食螨的碱基组成研究发现,碱基组成存在明显的偏向性,A+T含量明显高于G+C含量,这一现象在其他无脊椎动物线粒体DNA序列中也普遍存在；对五种肉食螨的COⅠ基因序列进行对比,可以看出:在核苷酸位点中,没有插入、缺失及终止密码子出现,共检测到348个变异位点,179个简约信息位点。
　　 从mtDNA-COⅠ分子水平上对马六甲肉食螨与近缘种间的遗传关系的初步研究表明:马六甲肉食螨与强壮肉食螨亲缘关系非常近,两者遗传距离为0～0.039,属于马六甲肉食螨9个不同地理种群间的遗传距离范围内；从变异位点来分析,马六甲肉食螨与强壮肉食螨COⅠ基因序列差异非常小,共有44个变异位点,仅增加8个新的变异位点；从系统进化树来看,强壮肉食螨5个地理种群聚在马六甲肉食螨9个地理种群内,而不是独立成一支,并且采自同一地区的这两种螨首先聚在一起,然后不同地理种群的这两种螨聚在一起,再与转开肉食螨聚在一起,故认为强壮肉食螨与马六甲肉食螨差异是属于种内水平。
　　 在对肉食螨线粒体DNA的COⅠ基因序列进行测定和分析的基础上,对肉食螨亚科5种肉食螨包括肉食螨属3种、触足螨属1种和真扇毛螨属1种,构建了分子系统发育树,从NJ和MP树显示,拓扑结构一致,肉食螨科3个属间的系统关系为(肉食螨属+触足螨属)+真扇毛螨属；5种肉食螨的系统关系为{[(马六甲肉食螨+强壮肉食螨)+转开肉食螨]+鳞翅触足螨)+中华真扇毛螨。
　　 2、五种肉食螨的12S rRNA基因系统分析
　　 对五种肉食螨的12S rRNA基因部分序列进行测定和分析。扩增的片段在碱基组成存在明显的偏向性,A+T含量明显高于G+C,这一现象也在其他蜱螨类中普遍存在。马六甲肉食螨6个不同地理种群的基因序列仅有一个碱基的差异,转开肉食螨的2个地理种群没有差异,遗传分化程度很小,肉食螨属内不同种之间(遗传距离为0～0.047)和不同属之间(遗传距离为0.074～0.118)有一定的分化现象,并且置信度较高,表明12S rRNA基因序列适合作为肉食螨种间、属间系统发生研究的分子标记,预示该基因不适合用于肉食螨种下遗传分化的分子标记。
　　 基于12S rRNA基因分子水平上对五种肉食螨遗传关系的初步研究表明:马六甲肉食螨与强壮肉食螨亲缘关系非常近,同一地理种群的两种肉食螨的序列是完全相同的,而马六甲肉食螨与另外三种肉食螨在系统进化树上可以很好的分开。故认为强壮肉食螨与马六甲肉食螨是属于种内水平。
　　 从NJ、MP系统树看出,肉食螨属的三种肉食螨首先聚在一起,然后与触足螨属的鳞翅触足螨聚在一起,再与真扇毛螨属的中华真扇毛螨聚在一起。基于12S rRNA基因构建的系统树显示肉食螨科3属间关系为:(肉食螨属+触足螨属)+真扇毛螨属。