基于核心家系的MDGA1基因多态性与精神分裂症的关联研究

摘要

目的：探讨MDGA1基因是否为中国汉族人群精神分裂症的风险基因，以核心家系为研究对象，分析MDGAl基因多态性与中国汉族精神分裂症患者的关联。
　　方法：共选择36个江西汉族精神分裂症核心家系为研究对象，共108例。选取目标基因MDGA1上6个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms，SNPs): rs6900617、rs11759115、rs7769372、rs9462341、rs12191311及rs804831。利用多重聚合酶链式反应(Multiplex PCR)，多重连接酶检测反应(Multiplexligase detection reaction，Multiplex LDR)技术检测个体基因型。运用拟合优度x2检验检测各位点基因型频数是否符合Hardy-Weinberg平衡，使用家系的关联分析软件（Family Based Associatin Test，FBAT）2.0.4版本，进行MDGA1基因多态性与精神分裂症的传递不平衡检验（Transmission disequilibrium test，TDT）和单倍型相对风险检测(haplotype relative risk，HRR)。
　　结果：MDGA1基因上6个SNP位点基因型分别在健康父母组及患病组中进行Hardy-Weinberg平衡检验，患病组中位点rs6900617和rs7769372x2分别为6.506和3.992，均显示出统计学差异(P＜0.05)，即不符合Hardy-Weinberg平衡。除此两位点外，其余四位点及健康父母组各位点均符合Hardy-Weinberg平衡检验;各等位基因及基因型频数分布分析结果得出，rs9462341与女性精神分裂症相关联(x2=4.125, df=1, P＜0.05);rs12191311、rs11759115、rs804831及rs9462341四位点进行单个位点TDT检验和HRR分析，结果显示在可加模型，隐性模型下，遗传标记位点rs9462341与精神分裂症关联，等位基因T过多传递，为精神分裂症的危险因素， P值分别为0.015777和0.005960，差异有统计学意义;显性模型下，等位基因A与精神分裂症提示关联(P=0.005960)，其对应的Z值为-2.750，等位基因A为精神分裂症的保护因素，位点rs9462341在核心家系中显示出传递不平衡性;而rs12191311、rs11759115及rs804831的TDT检验P值均大于0.05，表明此三位点与精神分裂症无关联。rs12191311-rs11759115-rs804831-rs9462341中的C/T/T/A的单倍型与精神分裂症相关，其P值为0.049861，对应的Z值为-1.961，提示C/T/T/A为精神分裂症的保护因素。其余各单倍型与精神分裂症均未显示出关联(P＞0.05)。
　　结论：⑴MDGA1基因rs9462341位点与精神分裂症相关联(P＜0.05)，等位基因T过多传递，为精神分裂症的危险因素，等位基因A为精神分裂症的保护因素；⑵rs12191311-rs11759115-rs804831-rs9462341组成的C/T/T/A的单倍型与精神分裂症关联(P＜0.05)；⑶MDGA1基因rs9462341位点与女性精神分裂症相关联；⑷MDGA1基因位点rs11759115、rs12191311和rs804831与精神分裂症无关联；⑸MDGA1基因可能是中国汉族人群精神分裂症患病基因。

目录

声明

摘要

中英文缩略词表

第1章 引言

1．1 精神分裂症概述

1．2 精神分裂症的病因学假说

1．2．1 神经递质假说

1．2．2 神经系统发育异常假说

1．3 精神分裂症的流行病学研究

1．4 精神分裂症的分子遗传学研究

1．5 关联研究

1．6 Hardy-Weinberg平衡检验

第2章 实验部分

2．1 MDGA1基因作为候选基因的理论依据

2．2 研究对象

2．3 实验材料与仪器设备

2．4 技术路线

2．5 基因组DNA提取

2．6 遗传标记选择

2．7 引物、探针设计合成及订购

2．8 多重PCR扩增目的片段

2．9 LDR及3730xl测序

2．10 数据库建立

2．10．1 统计分析指标

2．10．2 统计分析方法及软件

第3章 结果

3．1 基因型检测结果

3．2 各SNPs位点基因型分布和等位基因频率的对比结果

3．3 Hardy-Weinberg平衡的吻合度检验

3．4 基因SNP位点的等位基因TDT和HRR分析

3．4．1 手工计算进行单位点TDT分析

3．4．2 FBAT统计分析软件进行TDT和HRR分析

第4章 讨论

第5章 总结与展望

5．1 结论

5．2 展望

5．3 存在的问题和进一步的研究思路

5．3．1 存在的问题

5．3．2 进一步的研究思路

致谢

参考文献

综述 MDGA1基因与精神分裂症研究现状