论文说明
摘要
缩略词说明
第一章 绪论
1 遗传多样性的概念及畜禽遗传资源保护
1.1 遗传多样性的概念
1.2 畜禽遗传资源保护
2 我国地方鸭种起源及品种资源概况
2.1 我国地方鸭种起源与进化
2.2 我国地方鸭种遗传资源概况
2.3 地方鸭品种遗传多样性及群体结构研究进展
2.4 SSR标记及其在家禽遗传育种研究中的应用
2.5 mtDNA的遗传多样性与群体结构分析
2.6 系统发育树构建方法
2.7 本研究的目的与意义
第二章 基于STR分型技术分析我国部分地方鸭品种的遗传多样性与群体结构
1 材料与方法
1.1 样本采集
1.2 SSR引物选择
1.3 主要仪器与试剂
1.4 主要溶液的配制
1.5 鸭基因组总DNA提取
1.6 PCR反应体系及程序的优化
1.7 PCR产物检测
1.8 基于丙烯酰胺凝胶的基因型判定
1.9 荧光引物的筛选与组合
1.10 多色PCR扩增产物ABI-3730XL DNA Analyzer检测
1.11 统计原理与基因型判定方法
1.12 聚类方法
2 结果
2.1 基因组DNA的提取
2.2 普通PCR扩增产物PAGE电泳检测
2.3 筛选的标记引物及其组合
2.4 荧光PCR产物的STR分型
2.5 所选SSR座位的遗传参数
2.6 引物在单个群体中的群体遗传学参数
2.7 F统计量
2.8 单个群体的遗传学参数分析
2.9 遗传距离与其初步应用
2.10 PCA分析
2.11 群体结构分析
3 讨论
3.1 各群体的样本含量
3.2 SSR引物的选择及标记
3.3 群体遗传学参数与遗传距离
3.4 PCA与Structure程序分析
第三章 基于mtDNA D-loop区序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构
1 材料和方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 统计分析
2 结果与分析
2.1 mtDNA D-loop区扩增效果及测序结果
2.2 鸭mtDNA D-loop区的碱基组成
2.3 鸭mtDNAD-loop区遗传结构
2.4 鸭mtDNA D-loop区遗传多样性
2.5 聚类分析
2.6 Network网络图分析
3 讨论
第四章 基于COI基因序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 统计分析
2 结果
2.1 COI基因扩增效果及测序结果
2.2 鸭COI基因的碱基组成
2.3 鸭COI基因的遗传多样性
2.4 聚类分析
2.5 Network网络图分析
3 讨论
第五章 巢湖鸭异地小群保种效果监测
1 材料和方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
2 结果与分析
2.1 荧光PCR扩增产物检测分型结果
2.2 保种群体与原产地群体优势等位基因的比较
2.3 保种群体与原产地群体He、PIC的比较
3 讨论
第六章 全文结论
参考文献
附录
致谢
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