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大鼠烟气亚慢性暴露的蛋白水平差异表达研究

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引言

第一部分 大鼠烟气亚慢性暴露大鼠模型构建

前言

1. 材料与方法

2.结果

3.讨论

第二部分 烟气亚慢性暴露大鼠肺部的蛋白质组学分析

前言

1. 材料与方法

2. 实验结果

3. 讨论

参考文献

综述:蛋白质组学在哮喘和吸烟所引起的肺部疾病的诊断和监测中的作用

攻读学位期间发表的论文

致谢

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摘要

目的:本研究主要通过构建亚慢性暴露的大鼠模型来探究吸烟等因素对机体的影响,尤其是研究体内蛋白质表达水平的变化。
  方法:首先采用160只W is ta r大鼠构建烟气染毒模型,将实验大鼠随机分成10%香烟烟气浓度的低剂量组、20%烟气浓度的中剂量组、60%烟气浓度的高剂量组和对照组,染毒周期分别为3个月和6个月。然后分离大鼠的肺组织并将大鼠肺癌组织中蛋白质胰酶处理后进行蛋白质筛选和鉴定,iTRAQ进行定量分析,对照组(CM)、低剂量染毒组(LM)、中剂量染毒组(MM)、高剂量染毒组(HM),所提取的蛋白质样品经FASP酶解、iTRAQ试剂标记、高pHRPLC分离、RPLC-MS分离分析,获取的串联质谱数据通过软件搜库进行鉴定。
  结果:成功构建了大鼠的烟气亚慢性暴露模型,在通过质谱分析的数据中共收集到340258个光谱、19094个多肽和4483个蛋白。并根据肽段分子量的大小进行了统计分布的分析。通过蛋白的定量分析发现,不同剂量组之间的蛋白在表达水平的上有明显的差异。通过对蛋白进行聚类分析发现,和对照组相比,3个染毒组样本的上调或者下调有一定的剂量依赖性。GO功能的注释聚类分析发现,蛋白质主要集中在三个方面:分子功能、细胞位置、生物过程等;而C0G的注释分析发现蛋白质可以被归为26个簇中。通过KEGG数据库进行通路富集分析发现,3个不同剂量组与对照组相比,在不同数量的信号通路有明显的统计学意义。
  结论:论文首先对W is ta r大鼠进行构建烟气亚慢性模型,分为三个剂量组和对照组,构建成功后取大鼠的肺组织,分离提取蛋白质,进行蛋白质质谱分析。通过统计学分析发现,和对照组相比,三个不同剂量组的蛋白质有明显的差异性表达。这些差异蛋白质在功能上主要涉及到蛋白质代谢、PPAR信号通路,这些差异性的蛋白除了会影响肺部疾病之外,还影响到肥大性心肌病、扩张性心肌病、心肌收缩等,同时我们的研究还发现,这些蛋白质的差异存在一定程度上的依赖性。此蛋白质质谱方面的研究吸烟诱发的肺部疾病的机制方面的探索提供新的线索,同时也为寻找相关的肿瘤标志物提供重要的研究基础数据。

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