雁形目鸟类12S rRNA基因和细胞色素b基因序列变异及其分子系统学研究

摘要

雁形目鸟类(Anseriformes)是一个种类繁多的类群,共150种左右,除南极大陆外,在世界范围内广泛分布.该文首先对雁形目鸟类的系统发生研究进行了综述,然后分别基于雁形目鸟类线粒体DNA 12S rRNA基因和细胞色素b基因全序列的遗传变异分析,探讨了雁形目鸟类分子系统发生.具体包括以下几个部分:1、针对雁形目鸟类异常复杂的分类状况及分类上存在的争议,根据雁形目鸟类的形态学、行为学、骨骼学、角蛋白、线粒体与核DNA酶切片段长度多态、单拷贝核DNA-DNA杂交及线粒体基因DNA序列分析等方面的研究,对雁形目鸟类分类中科、亚科和族的划分及其相互间的系统发生关系进行综述,分析系统学研究中存在的不足,提出了雁形目鸟类分类中急需解决的问题.2、研究测定了雁形目(Anseriformes)19种mtDNA 12S rRNA基因全序列,结合GenBank中雁形目种类相关数据,分析了雁形目36种鸟类12S rRNA基因序列变异及其分子系统发生.序列比对后约1030bp,含346个核苷酸变异位点,259个简约信息位点.3、研究测定雁形目鸟类19种mtDNA细胞色素b基因全序列,结合Genbank中的4个物种,分析了雁形目鸟类细胞色素b基因的序列变异及其分子系统发生.系统发生分析表明:1)树鸭(Dendrocygna)在雁形目鸟类系统演化中较早分歧出来,在分类上可以成立树鸭科;2)鸭科种类可以分为鸭亚科和雁亚科两大支.3)在鸭亚科中,河鸭族在系统演化中形成单独的一支,与鸭亚科其余各族的关系较远;潜鸭族、栖鸭族、海鸭族和麻鸭族彼此间的亲缘关系较近.4)在雁亚科内,雁属(Anser)和天鹅属(Cygnus)均为单系发生,且互为姐妹群,支持雁亚科下设雁族和天鹅族.

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第一章雁形目鸟类分类及系统学研究进展

1雁形目科与亚科的划分

1.1科的划分

1.2亚科的划分

1.3亚科下的族划分

2雁形目系统发生关系研究概况

2.1科间系统发生关系

2.2亚科间系统发生关系

2.3族间系统发生关系研究

第二章雁形目鸟类12SrRNA基因序列变异及其分子系统学研究

1材料和方法

1.1实验材料

1.2方法

2结果

2.1雁形目12S rRNA基因的序列变异

2.2系统发生分析

3讨论

3.1雁形目科及亚科的划分

3.2鸭亚科族的划分及其系统发生关系

3.3雁亚科族的划分及其系统发生关系

3.4河鸭属几种鸟类系统发生关系

第三章雁形目鸟类细胞色素b基因序列序列变异及其分子系统学研究

1材料和方法

2结果

2.1雁形目细胞色素b基因的序列变异

2.2细胞色素b基因饱和分析

2.3系统发生分析

3讨论

3.1有关防止假基因扩增的问题

3.2雁形目鸟类细胞色素b基因序列的进化

3.3基于细胞色素b基因序列变异的系统发生关系

参考文献

致谢