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声明
第1章绪论
1.1基因表达调控及其研究意义
1.2转录因子结合位点识别方法的研究现状
1.3本文主要工作及意义
第2章转录因子结合位点的表示模型及数据处理
2.1转录因子结合位点的描述类型
2.1.1一致性序列模型
2.1.2矩阵模型
2.1.3可视化模型
2.2数据的获得
2.3数据的处理
2.3.1位置权重矩阵表示方法
2.3.2序列的打分
2.3.3样本的生成
第3章BP神经网络和遗传算法
3.1人工神经网络简介
3.1.1神经元形式化描述和人工神经网络模型
3.1.2 BP神经网络的原理及学习规则
3.1.3 BP网络的一些缺陷
3.2遗传算法的基本原理
3.2.1遗传算法的数学模型
3.2.2基本遗传算法的框架
3.2.3遗传算法实现的主要因素
第4章基于遗传神经网络的转录因子结合位点识别研究
4.1遗传算法结合神经网络
4.1.1基于遗传算法的BP网络权值的优化设计
4.1.2遗传算法优化BP网络的算法框架
4.1.3用MATLAB工具箱构造遗传神经网络
4.2算法在转录因子结合位点识别中的应用
4.2.1算法实现过程中的几个问题
4.2.2仿真程序流程
4.2.3实验过程
4.3实验数据比较与分析
4.3.1几个性能指标
4.3.2三种方法的比较与分析
4.4本章小结
第5章结束语
参考文献
致谢
在学期间公开发表论文及著作情况