伴童年创伤抑郁症患者DNA甲基化谱研究

摘要

目的:本研究利用全基因组DNA甲基化测序技术，探讨DNA甲基化修饰改变与童年创伤和抑郁症之间的关系，初步了解DNA甲基化在童年创伤和抑郁症机制中的作用。
　　方法:本研究分为伴童年创伤抑郁症患者组、不伴童年创伤抑郁症患者组、伴童年创伤健康成人组和不伴童年创伤健康对照组共四组，每组各3例。分别抽提各样本外周血组织中的基因组DNA，并采用MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation sequencing)测序技术进行DNA甲基化测序。
　　结果:通过运用MeDIP-seq测序技术，本阶段获得测序深度足够和高分辨率的外周血全基因组DNA甲基化谱。本次测序结果的整体原始数据高达60Gb，组间比较、GO(gene ontology)功能分析和Pathway分析后整体数据约80Gb。根据分析伴童年创伤抑郁症患者组与伴童年创伤健康成人组相比呈低甲基化改变的基因有11，623个，呈高甲基化改变的基因有12，772个。伴童年创伤抑郁症患者组与不伴童年创伤抑郁症患者组相比呈低甲基化改变的基因有12，838个，呈高甲基化改变的基因有12，709个。伴童年创伤健康成人组和不伴童年创伤健康对照组相比呈低甲基化改变的基因有12，228个，呈高甲基化改变的基因有12，664个。不伴童年创伤抑郁患者组和不伴童年创伤健康对照组相比呈低甲基化改变的基因有12，039个，呈高甲基化改变的基因有13，661个。GO分析显示甲基化异常改变明显的基因类型包括:生物进程的(biological process)中的生物调节、细胞生理过程、代谢过程、生物过程的调节、信号转导和信号转导过程;细胞组分(cellular component)部分改变主要集中在细胞构架、细胞器;在分子功能(molecular function)部分主要集中在分子结合、催化活性等。
　　结论:本次研究发现童年创伤和抑郁症中均存在DNA甲基化修饰的改变，表明DNA甲基化修饰的改变可能与童年创伤和抑郁症的发生有一定的关系。

目录

声明

论文说明

摘要

符号说明

1 前言

1．1 童年创伤与抑郁症

1．2 甲基化的生物学机制及相关测序技术

1．3 甲基化在童年创伤抑郁症研究中的进展

1．4 研究假设和目的

2 研究设计与方法

2．1 研究对象

2．2 主要仪器及试剂

2．3 实验方法

2．4 信息分析

3 结果

3．1 分组情况

3．2 DNA抽提结果

3．3 数据处理

3．4 标准信息分析

4 讨论

5 结论

参考文献

攻读学位期间的研究成果

致谢