声明
论文创新点
1 引言
1.1 多维生物医学大数据简述
1.2 基于网络的生物医学研究简述
1.3 生物网络系统的可控性研究简述
1.4 张量理论及其在生物医学中的应用
1.5 本文的主要研究工作及组织结构
2 基于共表达网络的数学建模和定量分析预测基因异构体的生物学功能
2.1 研究思路概述
2.2 基于外显子组学数据构建共表达网络
2.3 共表达网络构建方法的性能评估
2.4 基于共表达网络的定量分析预测基因异构体的生物学功能
2.5 本章小结
3 在张量计算框架下识别多层生物网络的关键节点
3.1 研究思路概述
3.2 多层癌症网络的构建
3.3 多层网络的张量奇异向量中心性
3.4 数值实验
3.5 本章小结
4 多尺度生物网络的可控性和控制能量研究
4.1 研究思路概述
4.2 单层网络的控制能量评估和控制策略设计
4.3 多层网络的可控性和控制能量研究
4.4 本章小结
5 整合时间和空间尺度的时序多层生物网络建模及其定量分析
5.1 研究思路概述
5.2 时序多层网络的数学模型
5.3 时序多层网络的张量表示和定量指标
5.4 时序多层网络的迭代优化中心性
5.5 数值实验
5.6 本章小结
6 总结与展望
6.1 全文总结
6.2 进一步研究工作的展望
附录 A 12 个转录因子异构体功能分析的相关图形汇总
附录 B 两个实际时序多层生物网络简述
参考文献
攻博期间发表的科研成果目录
致谢
武汉大学;
