QSAR及其在新型农药分子设计中的应用

摘要

定量构效关系(QSAR)研究是农药分子设计中很重要的方法，本文详细介绍了2D-QSAR中的Hansch-Fujita方法及3D-QSAR中的比较分子场分析(CoMFA)方法和比较分子相似指数分析(CoMSIA)方法，并对Hansch-Fujita方法中使用的各种类型的参数进行了比较分析。为了更全面地揭示2-芳基苯并二氢吡喃-4-酮类衍生物的抗菌活性与其结构之间的关系，在本课题组前期进行的Hansch-Fujita QSAR分析的基础上，采用CoMFA、CoMSIA等3D-QSAR分析方法对其三维结构活性关系进行了探讨。本研究从氯嘧磺隆与AHAS酶催化亚基复合物晶体中提取氯嘧磺隆的构象为初始构象，构建了一系列磺酰脲类化合物。在DFT方法下，采用B3LYP函数对构建的结构进行了优化，并计算了基于静电势拟合的电荷。利用DFT方法计算的量子化学参数进行了Hansch-FujitaQSAR分析，同时采用CoMFA和CoMSIA等方法对磺酰脲类化合物的结构活性关系进行了探讨。得到的QSAR模型进一步验证了复合物中磺酰脲化合物与酶的连接模式，并为下一步的虚拟筛选提供了一个非常有用的工具。

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第一章文献综述

1.1二维定量构效关系方法

1.1.1 Free-Wilson法

1.1.2分子连接性法

1.1.3 Hansch-Fujita法

1.2三维定量构效关系方法(3D-QSAR)

1.2.1比较分子场分析

1.2.2分子相似性指数分析

1.3展望与本文的研究意义和目的

第二章具有抗菌活性的2-芳基苯并二氢吡喃-4-酮类化合物作用模型的构建

2.1分析数据组

2.2 3D-QSAR分析

2.2.1分子模拟和叠合规则

2.2.2 CoMFA和CoMSIA参数

2.2.3 CoMFA和CoMSIA的分析结果和讨论

2.3 Hansch-Fujita分析

2.4 2D-QSAR和3D-QSAR的结合分析与连接模式的构建

第三章磺酰脲类除草活性分子的定量构效关系研究

3.1氯嘧磺隆(CE)与酵母AHAS酶催化亚基复合物的晶体结构以及除草剂的结合方式

3.2活性数据与分子模拟

3.3 Hansch-Fujita分析

3.3.1量子化学参数

3.3.2结果和讨论

3.4磺酰脲化合物的3D-QSAR研究

3.4.1叠合规则

3.4.2 CoMFA和CoMSIA参数

3.4.2 CoMFA和CoMSIA分析的结果和讨论

第四章全文总结

参考文献

在校期间发表的论文、科研成果等

致谢