中国H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因的分子进化研究

摘要

为了了解中国大陆流行的H3N2亚型人流感病毒的NA基因变异特征与规律、进化趋势和毒株对NA抑制剂药物的耐药情况，本研究按一定原则选取了1968～2005年间国家流感中心保存的585株H3N2亚型人流感病毒毒株，通过对其NA基因的序列测定，采用生物信息学工具对序列进行分析，得出以下结论： (1)我国历年来NA基因的进化路径主要是以一主要的进化主干伴随着多侧支的方式进化，序列的差距与年代大体成正比，NA的进化不存在明显的地域特征，流感病毒株新变种的出现，在时间上无周期性。 (2)疫苗株在我国历年来NA的核苷酸和氨基酸进化树上存在明显的滞后现象。 (3)NA氨基酸和核苷酸各年间的进化率呈折叠形，流行高峰年份的毒株进化率位于峰点。从整体上看，氨基酸的进化速度大于核苷酸，抗原决定簇位点的进化最快，茎部与跨膜区次之，但是流行高峰期，具体到哪些位点会发生变异，没有规律可言。 (4)NA历年来只有48％的氨基酸位点出现变异，大部分位点保守且没有氨基酸的缺失与插入。7个抗原决定簇变异率均不相同，197～199位变异率最高，是最重要的抗原位点，而153位变异率最低；所有位点中197位变异最快。NA的酶活性位点高度保守，且我国1968～2005年间在基因水平上没有监测到耐药株。二硫键和糖基化位点相对保守，糖基化位点突然出现与消失可能是引起流感流行的原因之一。通过分析还发现143、267和385位氨基酸的变异率高于抗原决定簇位点，但具体生物学意义不清楚。 (5)本研究是首次对中国大陆历年来H3N2亚型人流感病毒NA基因进行分子进化分析，首次阐明了我国H3N2亚型人流感病毒NA基因的特性和进化情况。这为以后我国大陆的流感监测与防治工作提供了基础理论依据以及为NA抑制剂药物的使用提供指导作用。

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第一章文献综述

1流感病毒概述

1.1流感的历史

1.2流感病毒的毒粒结构及特征

1.3流感病毒神经氨酸酶的结构和功能

1.4流感病毒的宿主范围

1.5流感病毒的抗原性变异

2 H3N2亚型人流感病毒NA基因的分子进化研究进展

2.1 H3N2亚型人流感病毒NA基因的分子进化研究的国内外进展

2.2对我国H3N2亚型人流感病毒NA基因的分子进化研究的目的和意义

第二章1968～2005年中国H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因的序列测定及分析

1材料和方法

1.1材料

1.2方法

2结果

2.1 1968～2005年我国H3N2亚型人流感病毒NA基因的分子进化分析

2.2 1968～2005年我国H3N2亚型人流感病毒NA基因推导的氨基酸序列变异情况

3讨论

4结论

参考文献

附录

致谢

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