基因组扫描法定位猪1、2、6号染色体重要经济性状QTL的研究

摘要

该试验以3头大白公猪和7头梅山母猪为基础群建立F<,2>参考家系,选留F<,2>代个体140头.屠宰前测量活体性状并记录;屠宰后测量并记录生长,胴体,肉质等生产性状.对24个微卫星位点进行PCR扩增,判断基因型,取得如下结果：1.各微卫星标记平均等位基因数为3.33,平均有信息减数分裂数为138.21,平均杂合度为0.561,平均多态信息为0.488.选择的微卫星标记具有较高的信息含量,可以满足连锁图谱构建和QTL定位的要求.2.用CRIMAP软件包进行资源家系群体1,2和6号染色体遗传连锁图谱的构建,各条染色体长度分别为181.5cM,153.8cM,198.6cM,各条染色体平均标记间隔为25.381cM.与USDA-MARC图谱相比较长,标记的排列顺序与USDA-MARC图谱一致.3.用线性模型最小二乘法对数量性状进行QTL区间定位,利用置换法（permutation)确定显著性阈值.5.在三条染色体定位的各种性状的QTL位置具有一定的规律性,相关比较紧密的性状往往定位在染色体上相同或邻近的区间内,如影响活体估测性状的QTL均定位于2号染色体60-65cM区间内,有关大理石纹与肌内脂肪的肉质性状QTL多定位在6号染色体的近端,这提示我们这些QTL之间可能存在一因多效或基因互作.

目录

Abstract

1.文献综述

1.1.杂种优势的研究进展概况

1.1.1杂种优势与分子标记的杂合度之间的相关性研究

1.1.2.杂种优势与QTL定位的相关性研究

1.1.3杂种优势与基因差异表达的相关性

1.2.分子标记概况

1.2.1.分子标记的种类和特点

1.2.2.分子标记在猪育种中的应用

1.3.猪基因组QTL定位的研究进展

1.3.1.基因组作图的进展概况和QTL定位的基本方法

1.3.2生长与生产性能性状的QTL及主效基因进展概况

1.3.3肉质性状的QTL及主效基因进展概况

1.3.4繁殖性状的QTL及主效基因进展概况

1.3.5抗病和免疫反应性状的QTL及主效基因进展概况

1.4.QTL定位方法及统计分析技术研究进展

1.4.1.数量性状位点(QTL)定位统计方法

1.4.2.QTL定位统计方法研究进展

2.试验的目的和意义

3.材料与方法

3.1试验猪群

3.2表型性状的度量

3.2.1活体度量性状

3.2.2屠宰现场测定性状

3.3群体基因型分析

3.3.1主要仪器设备

3.3.2主要药品及试剂

3.3.3主要试剂和溶液的配制

3.3.4基因组DNA的提取与质量检测

3.3.5微卫星标记

3.3.6猪应激敏感基因的PCR-RFLP分析

3.4数据统计分析

3.4.1微卫星标记杂合度和多态信息含量的统计

3.4.2遗传连锁图谱的构建

3.4.3性状记录的数据分析

3.4.4.QTL定位分析

4.结果与分析

4.1.微卫星标记

4.1.1微卫星PCR扩增结果

4.1.2微卫星标记的性质

4.2.参考家系中氟烷基因检测结果

4.3.猪的遗传连锁图谱构建

4.4.群体表型性状统计分析

4.4.1.生长性状统计分析

4.4.2.胴体性状统计分析

4.4.3.内脏性状统计分析

4.4.4.肉质性状统计分析

4.4.5.活体测量性状统计分析

4.5.数量性状QTL定位分析

4.5.1.1号染色体单一位置及染色体水平区间定位结果

4.5.2.2号染色体单一位置及染色体水平区间定位分析结果

4.5.3.6号染色体单一位置及染色体水平区间定位结果

4.5.4.QTL印记效应的分析

4.5.5.2QTL模型定位分析

4.5.6.达到染色体显著水平以上的QTL总结

5.讨论

5.1.关于微卫星扩增结果的正确性

5.2.关于本研究遗传图构建结果

5.3.关于猪1、2、6号染色体QTL的鉴定

5.4.关于参考家系的利用

5.5.关于QTL的印记效应与杂种优势

5.6.关于进一步的工作

6.结论

参考文献

致 谢

附 录