中国南方沿海3种经济鲍养殖群体遗传多样性分析

摘要

本文为评估三种经济鲍的遗传变异现状，利用RAPD分子标记技术研究了福建(东山)、广东(惠来、深圳、湛江)和海南(三亚)3省沿海五个九孔鲍养殖群体的遗传多样性和遗传结构，利用微卫星分子标记技术研究了福建东山和广东惠来养殖的皱纹盘鲍和盘鲍4个群体的遗传多样性。 九孔鲍的RAPD研究发现，54个随机引物中，22个引物扩增稳定用于统计分析。5个养殖群体172个个体中共产生180条大小在0.2～2.4kb之间的扩增条带，平均多态位点比例91.4％。湛江群体基因多样性最高，为0.344，惠来群体最低，为0.259；群体基因多样性的t检验显示，东山、深圳和三亚群体相互间平均基因多样性差异并不显著(P>0.05)，而其他群体相互间差异显著(P<0.01)。 五个养殖群体总体基因多样性H<,T.、群体间平均基因多样性H<,S>、群体间遗传分化量D<,ST>和遗传分化系数G<,ST>分别为0.381，0.313，0.068和0.179。G<,ST>介于0.076和0.246之间。分子方差分析(AMOVA)显示，76.7％的遗传变异来自于群体内部个体间的差异，群体间的遗传变异占总变异的23.3％。群体间F<,ST>为0.102～0.297，揭示了与G<,ST>相似的遗传分化格局。UPGMA聚类分析显示5个群体聚为2支，深圳、湛江与三亚群体聚为一支，东山和惠来群体聚为另一支。但AMOVA显示，东山和惠来群体组与深圳、湛江和三亚群体组间遗传分化并不显著(F<,CT>=0.103，P=-0.099)。随机组合检验表明，群体间呈显著的遗传分化状态，各地方群体应分别作为单独的“管理单元(management unit)”进行遗传资源管理，群体之间的移植应严格监管。 皱纹盘鲍和盘鲍的9对引物中，4对引物可同时在两种鲍中稳定扩增。4个微卫星位点共检测出24个等位基因；有效等位基因数为2.214～6.001，平均有效等位基因数为4.110；多态信息含量PIC值均在0.5以上，变化范围为0.512～0.812；观测杂合度介于0.382到0.677之间，平均0.521；期望杂合度的变化范围为0.550～0.836，平均0.705；各位点观测杂合度均低于期望杂合度，杂合子偏离度D值均为负。4个养殖群体中，2个皱纹盘鲍养殖群体的等位基因数和有效等位基因数均大于2个盘鲍养殖群体；PIC值和期望杂合度排序均依次为：惠来盘鲍>惠来皱纹盘鲍>东山皱纹盘鲍>东山盘鲍。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验发现，仅有东山皱纹盘鲍在位点Hdd108C、东山盘鲍和惠来盘鲍在位点Hdd115B符合Hardy-Weinberg平衡。 4个位点平均近交系数为0.228。AMOVA表明，南方养殖的皱纹盘鲍和盘鲍95.22％的遗传变异存在于群体内，群体间的遗传变异仅为总遗传变异的4.78％，但群体间的遗传分化显著(F<,SC>=0.048，P<0.001)。根据Nei(1972)的方法计算的群体之间的遗传距离为0.084～0.186，惠来盘鲍群体与东山盘鲍之间的遗传距离最小，东山盘鲍与东山皱纹盘鲍之间遗传距离最大。UPGMA聚类分析表明，东山盘鲍与惠来盘鲍群体间亲缘关系最近，并与惠来皱纹盘鲍聚为一类，东山皱纹盘鲍与其它群体间亲缘关系较远。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：缩略词表

声明

第1章文献综述

1遗传多样性研究的原理与方法

1.1遗传多样性的含义及意义

1.2遗传多样性的检测方法

2随机扩增多态DNA(RAPD)分析技术

2.1 RAPD技术的原理

2.2 RAPD技术的优缺点

2.3 RAPD技术在水产动物群体遗传变异研究中的应用

3微卫星DNA分析技术

3.1微卫星技术的原理

3.2微卫星技术的优缺点

3.3微卫星技术在水产动物群体遗传变异研究中的应用

4鲍的遗传多样性研究

4.1我国养殖鲍概况

4.2鲍的遗传多样性研究进展

5研究目的、意义

第2章九孔鲍养殖群体遗传多样性的RAPD分析

1引言

2材料与方法

2.1样品采集

2.2主要实验仪器和试剂

2.3研究方法

3结果

3.1 RAPD扩增结果和群体基因多样性

3.2遗传分化与聚类分析

4讨论

4.1群体内基因多样性

4.2群体间遗传分化和亲缘关系

第3章皱纹盘鲍和盘鲍南方养殖群体遗传变异的微卫星分析

1引言

2材料与方法

2.1样品采集

2.2主要实验仪器和试剂

2.3研究方法

3结果

3.1扩增结果

3.2微卫星位点的遗传多态性

3.3群体内的遗传多样性

3.4 Hardy-Weinberg平衡的卡方检验

3.5群体间遗传分化和聚类分析

4讨论

4.1皱纹盘鲍和盘鲍的微卫星引物的适用性

4.2养殖群体遗传多样性

4.3群体间遗传分化和亲缘关系

第4章小结与展望

参考文献

致谢

附录