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缩写名词表
1 文献综述
1.1 植物功能基因组学研究概述
1.2 植物功能基因组研究的主要策略
1.2.1 基于序列的基因功能研究
1.2.2 基于芯片技术的基因功能分析
1.2.3 基于功能丧失型突变的基因功能研究
1.2.4 基于改变表达模式的基因功能研究
1.3 报告基因和Gene Traps
1.3.1 报告基因及其种类
1.3.2 报告基因应用于Gene Traps系统
1.4 表达谱技术
1.4.1 基于芯片技术的表达谱
1.4.2 基于新一代测序技术的表达谱
1.4.3 报告基因表达谱
1.5 基于双因子反式激活元件的异位表达系统
1.5.1 植物中常用的双因子反式激活元件
1.5.2 GAL4/UAS元件在植物功能基因组学中的应用
1.5.3 基于GAL4/UAS系统的报告基因表达模式系的构建
1.6 植物开花期基因研究进展
1.6.1 拟南芥开花调控途径研究进展
1.6.2 成花素(Florigen)的研究
1.6.3 水稻抽穗期基因的研究
2 本研究的目的和意义
3 材料与方法
3.1 实验材料
3.1.1 植物材料及菌株材料
3.1.2 实验中用到的主要骨架载体
3.2 实验方法
3.2.1 本研究相关载体的构建
3.2.2 水稻材料的遗传转化
3.2.3 水稻材料的种植
3.2.4 转基因植株DNA抽取及阳性检测
3.2.5 转基因材料活体GFP表达观测
3.3.6 转基因材料切片及GFP表达观测
3.2.7 转基因材料T-DNA插入拷贝数的检测
3.2.8 T-DNA插入位点侧翼序列的分离
3.2.9 水稻的杂交
3.2.10 GUS报告基因表达检测
3.2.11 SAM电镜观测
4 结果与分析
4.1 水稻Enhancer trap系材料的获得
4.2 构建报告基因表达谱材料的选择及阳性检测
4.3 报告基因表达谱的构建
4.3.1 T0代报告基因表达观测
4.3.2 模式系材料T1代报告基因表达复筛
4.3.3 特异表达模式系的获得
4.3.4 模式系T-DNA插入拷贝数的检测
4.4 GUS目标系的获得及异位表达系统的验证
4.5 利用模式系监测组织器官发育过程
4.6 模式系侧翼序列的分离及分析
4.7 构建模式系材料突变表型的筛选
4.8 控制水稻开花期基因RID1的功能研究
4.8.1 rid1迟抽穗突变体的获得及表型描述
4.8.2 rid1迟抽穗突变体的互补验证
4.8.3 RID1基因表达部位检测
4.8.4 RID1基因在其他品种水稻品种中也起重要作用
4.8.5 几个水稻开花期相关基因的遗传转化
5 讨论及展望
5.1 Enhancer Trap系中的GAL4/UAS系统的一些问题
5.2 模式系的特异性
5.3 报告基因的选择与观测
5.4 模式系和目标系的构建
5.5 特异表达模式系的应用
5.6 基于特异表达模式系的异位表达系统的应用
5.7 水稻抽穗调控途径的研究
5.8 RID1基因作用机理的探讨
5.9 RID1基因的进一步研究设想
附录1 :部分试验的详细步骤及试剂配方
附录2 :拷贝数及田间编号信息
参考文献
作者简历
致谢