大白猪ESR、FSHβ、RBP4、LEF-1和PPARD基因多态性与重要经济性状的相关性研究

摘要

分子标记辅助选择(Marker-assisted selection，MAS)相对于传统的育种技术，在早期选择、选择准确性等方面具有显著的优越性，与常规育种方法相结合，促进了种猪重要经济性状的遗传改良进程。因此，在不同的猪种群体中对已发现的分子标记进行多态性检测和遗传效应分析，可以为分子标记在猪育种中的应用提供重要的理论依据。本试验采用PCR-RFLP技术，在美系大白（633头）、法系大白(963头)群体中，分别对ESR、FSHβ、RBP4、LEF-1和PPARD基因的多态性进行检测和遗传效应分析。
　　研究结果如下:
　　(1)在美系和法系大白猪中，检测到ESR、FSHβ和RBP4基因均存在三种基因型（AA、AB和BB基因型），关联分析结果表明:在美系和法系大白猪中，初产和经产母猪ESR基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AB基因型和AA基因型个体(P＜0.05);美系初产和经产大白母猪中，FSHβ基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AA基因型个体(P＜0.05);在美系和法系大白猪中，初产和经产母猪RBP4基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AA基因型个体(P＜0.05);另外，在美系大白猪中也检测到LEF-1基因三种基因型（AA、AG和GG基因型）的存在，但不同基因型个体之间乳头数无显著差异。
　　(2)在美系和法系大白猪中检测到PPARD基因存在三种基因型（AA、AG和GG基因型），关联分析结果表明:大白猪的AA基因型个体的背膘厚显著低于AG基因型和GG基因型个体(P＜0.05);同时AA基因型个体的体长显著长于AG基因型和GG基因型个体(P＜0.05)。利用实时定量PCR和western blot技术分析了在携带GG和AG基因型的法系大白猪PPARD基因在肌肉和脂肪组织中的差异表达情况，发现GG基因型个体在mRNA和蛋白水平上的目的基因表达量均显著高于AG基因型个体(P＜0.05)。
　　以上研究结果表明:ESR基因变异对美系和法系大白母猪的产仔数和初生窝重具有显著的遗传效应，可以应用于大白母猪产仔数的标记辅助选择;FSHβ和RBP4基因研究结果与现有报道不尽一致，用于大白母猪育种工作还有待进一步验证;在大白猪群中PPARD基因多态性对背膘厚和体长有显著影响，在育种中可通过提高有利等位基因A的基因频率，从而降低大白猪的背膘厚和增加体长。

目录

论文说明

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摘要

中英文缩略词表

第一章 文献综述

1 引言

2 猪经济性状QTL的定位及相关候选基因的研究进展

2．1 猪经济性状QTL在不同染色体上的定位分布

2．2 猪不同经济性状QTL的定位及候选基因的鉴定

3 ESR、FSHβ、RBP4、LEF-1和PPARD基因多态性在猪育种中的研究进展

3．1 猪ESR、FSHβ、RBP4和LEF-1基因对繁殖性能的影响

3．2 猪PPARD基因对脂肪沉积性状及耳朵面积大小的影响

4 本研究的目的和意义

第二章 材料和方法

1 试验材料

1．1 试验猪群及性状测定

1．2 所用试剂及药品

1．3 所用仪器和设备

1．4 常用试剂配制

2 试验方法

2．1 猪血液基因组DNA提取

2．2 猪ESR、FSHβ、RBP4、LEF-1和PPARD基因的基因型检测

2．3 分子标记的基因效应分析

2．4 猪组织RNA和蛋白质的提取

2．5 猪PPARD基因5’端调控区SNP在体内对其表达量的影响分析

第三章 结果与分析

1 猪血液基因组DNA提取结果

2 猪ESR基因的遗传变异及其对繁殖性状的影响

2．1 ESR基因的PCR-PvuⅡ-RFLP多态性检测

2．2 ESR.基因在大白猪中的基因频率分布及与繁殖性状的关联分析

3 猪FSHβ基因的遗传变异及其对繁殖性状的影晌

3．1 FSHβ基因的PCR多态性检测

3．2 FSHβ基因在大白猪中的基因频率分布及与繁殖性状的关联分析

4 猪RBP4基因的遗传变异及其对繁殖性状的影响

4．1 RBP4基因的PCR-MspⅠ-RFLP多态性检测

4．2 RBP4基因在大白猪中的基因频率分布及与繁殖性状的关联分析

5 猪LEF-1基因的遗传变异及其对乳头数和生长-I生状的影响

5．1 LEF-1基因的PCR-EcoRⅡ-RFLP多态性检测

5．2 LEF-1基因在大白猪中的基因频率分布及与乳头数和生长性状的关联分析

6 猪PPARD基因的遗传变异及其对生长育肥性状和基因表达量的影响

6．1 PPARD基因的PCR-EcoRⅠ-RFLP多态性检测

6．2 PPARD基因在大白猪中的基因频率分布及与生长性状的关联分析

6．3 PPARD基因5’上游调控区的SNP(g.1015A>G)在体内对其表达量的影响

第四章 讨论

1 ESR、FSHβ和RBP4基因多态性对大白母猪繁殖性状的影响

1．1 ESR基因多态性与大白母猪繁殖性能的关联分析

1．2 FSHβ基因多态性与大白母猪繁殖性能的关联分析

1．3 RBP4基因多态性与大白母猪繁殖性能的关联分析

2 LEF-1基因多态性对大白猪乳头数和生长性状的影响

3 PPARD基因多态性对大白猪生长育肥性状及其表达量的影晌

第五章 小结

1 本研究得到的结论

2 下一步工作计划

参考文献

致谢