声明
摘要
缩略词表
1文献综述
1．1油菜及其它植物含油量位点鉴定研究进展
1．1．1油菜含油量性状定位研究现状
1．1．2模式植物拟南芥油脂代谢相关研究进展
1．1．3其它油料作物中含油量位点的遗传研究进展
1．2 GWAS分析及多组学关联分析
1．2．1 GWAS分析
1．2．2多组学关联分析
1．3研究目的和意义
2材料和方法
2．1实验材料
2．2田间实验及表型考察
2．3．1高质量植物总DNA的提取和测序
2．3．2高质量植物总RNA的提取和测序
2．4甘蓝型油菜群体基因型鉴定以及含油量关联分析
2．4．1油菜群体基因型鉴定
2．4．2甘蓝型油菜群体结构分析以及系统发育树构建
2．4．3连锁不平衡的衰减距离分析
2．4．4甘蓝型油菜含油量全基因组关联分析
2．5甘蓝型油菜种子eQTL定位分析
2．5．1 RNA-seq数据处理
2．5．2 eQTL分析
2．5．3 Trans eQTL热点鉴定
3结果与分析
3．1甘蓝型油菜自然群体含油量表型多样性
3．2 SNP标记密度分布统计
3．3甘蓝型油菜群体连锁不平衡分析
3．4甘蓝型油菜群体结构分析
3．5油菜群体含油量性状全基因组关联分析
3．6 OC-A9-5和OC-A5-2目标区段候选基因鉴定
3．6．1 OC-A9-5含油量位点的候选基因鉴定
3．6．2 OC-A5-2含油量位点的候选基因鉴定
3．7甘蓝型油菜eQTL定位分析
3．8含油量位点和eQTL整合分析
4结果讨论与展望
4．1结果讨论
4．1．1影响GWAS结果的因素
4．1．2整合转录组数据对甘蓝型油菜含油量位点进行解析
4．2展望
参考文献
附录
攻读硕士期间发表论文
致谢
