声明
摘要
缩略语表
第一章文献综述
1．1梨炭疽病的研究概况
1．1．1我国梨炭疽病的发生与危害
1．1．2梨炭疽病的种类鉴定
1．1．3梨炭疽病的防治
1．2刺盘孢属真菌的研究概况
1．2．1刺盘孢属真菌的分类研究
1．2．2梨炭疽病的病原菌种类
1．2．3刺盘孢属真菌生活方式
1．3刺盘孢属真菌与寄主的互作研究
1．3．1植物免疫系统
1．3．2效应子
1．3．3植物激素
1．3．4转录组测序技术在刺盘孢属真菌与寄主互作研究中的应用
1．4研究的目的及意义
第二章中国梨炭疽病的病原菌种类鉴定及其遗传多样性分析
2．1材料与方法
2．1．1样品采集与病原菌分离
2．1．2形态学观察
2．1．3基因组DNA的提取
2．1．4 PCR扩增
2．1．5 PCR产物的回收纯化、克隆和测序
2．1．6系统发育分析
2．1．7系谱一致性系统发育物种识别(GCPSR)
2．1．8流行性分析
2．1．9致病性测定
2．1．10致病力评估
2．1．11数据处理
2．2结果与分析
2．2．1梨炭疽病的田间症状类型
2．2．2梨炭疽病菌菌株的收集
2．2．3梨炭疽病菌系统发育学研究
2．2．4成对相似性(PHI)测验
2．2．5梨炭疽病菌培养和形态特征
2．2．6中国梨炭疽病菌种类分布分析
2．2．7致病性测定
2．2．8致病力评估
2．3结论与讨论
第三章果生刺盘孢及其侵染梨叶片的同期转录组分析
3．1材料与方法
3．1．1供试菌株及接种体的制备
3．1．2供试植株及活体梨苗接种
3．1．3总RNA提取、cDNA文库构建及转录组测序
3．1．4转录组测序数据分析
3．1．5总RNA的提取、DNA消化及反转录
3．1．6引物设计及实时荧光定量PCR
3．1．7候选效应子的筛选
3．1．8系统发育分析
3．2．1活体梨苗接种
3．2．2总RNA提取质量分析
3．2．3 RNA-Seq数据质量分析
3．2．4差异表达基因的筛选
3．2．5差异表达基因的GO分类分析
3．2．6差异表达基因的KEGG富集分析
3．2．7实时荧光定量验证
3．2．8 PAMP触发的免疫(PTI)和Effector触发的免疫(ETI)的激活
3．2．9接种不同菌株后砂梨叶片表现差异的植物激素免疫
3．2．10苯丙烷类代谢途径参与砂梨叶片对C．fructicola的抗病
3．2．11多种转录因子参与调节砂梨叶片对C．fructicola的免疫应答
3．2．12 C．fructicola候选效应子的筛选
3．2．13果生刺盘孢CfCP1和CfE1序列分析
3．2．14 CfCP1和cfE1基因的表达模式
3．3结论与讨论
第四章全文结论与展望
4．1全文结论
4．2论文主要创新点
4．3展望
参考文献
附录
致谢
