文摘
英文文摘
第1章绪论
1.1研究的目的和意义
1.2国内外现状
1.3本文的贡献
1.4论文结构
第2章背景知识介绍
2.1 Motif发现算法回顾
2.1.1序列谱模型算法
2.1.2一致模型算法
第3章基于样板的贪心EM混合模型算法-SEMM
3.1混合模型算法的数学基础
3.2基于样板的EM混合模型算法-SEMM算法
3.2.1选集的生成
3.2.2算法描述
3.3.3算法性能及算法的实验结果
第4章SSNT算法-新的精确motif发现方法
4.1模式扩展
4.2候选筛
4.3算法的描述
4.4算法的性能和实验结果
第5章起动子motif关联集差异分析
5.1问题的定义
5.2 FPD-树算法-基于FP-树的关联规则算法
5.2.1算法描述
5.3 DAAR算法-起动子关联集差异分析算法
5.3.1算法描述
5.4算法性能和实验结果
总结
致谢
攻读硕士学位期间所发表的论文
参考文献
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