动态性状基因位点定位的方法研究

摘要

对任何生物的生长和发育过程中具有不同的时间和空间特征，这种伴随时间和数量因素变化的性状称之为动态性状.从生物学的角度来说，动植物性状的表型变化是否表达可能与不同的时间和不同的基因相关，也可以说控制动态性状的基因效应是随着时间变化而变化的基因.动态性状因其实用性和重要性受到广大动植物遗传育种研究者的青睐，因此研究动态性状基因的定位和遗传效应能够提高我们对其遗传结构的深刻理解和认识.将数量性状位点基因的定位与动态性状遗传的特征相结合起来的近期研究情况，本文对动态性状基因位点定位的方法进行优化，利用特殊群体阐述基因位点定位的方法，为基因定位的发展提供了一定的理论基础和实用价值.
　　本文提出的新方法是将与时间有关的切比雪夫多项式嵌套在遗传模型中的每个遗传效应中，用来描述QTL和标记对动态性状的影响，利用复合区间定位来进行动态性状的基因定位，进而建立动态性状区间定位的统计模型.文中选用F2代群体为例，描述动态性状复合区间定位的方法，利用EM算法估计模型中的参数.为了比较应用切比雪夫多项式的新方法与基于勒让德多项式的已有方法的定位效果，本文进行了一定的模拟研究，模拟结果表明本文提出切比雪夫多项式方法在一定程度优于原来的方法.

目录

摘要

第1章 绪论

1．1 研究的背景及其意义

1．2 研究的发展现状

1．3 本文主要工作和结构框架

第2章 预备知识

2．1 QTL定位的相关遗传术语

2．1．1 染色体、位点、等位基因、基因型与表现型

2．1．2 图距、重组率、图谱函数

2．2 QTL定位的相关算法和检验

2．2．1 算法

2．2．2 检验方法

2．3 QTL定位的几种方法

2．3．1 单标记定位

2．3．2 单区间定位

2．3．3 复合区间定位

2．3．4 基于混合线性模型下区间定位

2．3．5 其他区间定位方法

第3章 动态性状基因定位理论与方法

3．1 遗传模型

3．2 参数估计

3．3 假设检验

第4章 模拟研究

4．1 模拟设计

4．2 模拟结果

总结和讨论

参考文献

致谢

攻读学位期间发表的学术论文

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