大豆基因组作图和重要农艺性状的基因定位

摘要

该研究利用美国半矮杆大豆品种Charleston和东农高蛋白大豆品系东农594(NEAU594)杂交,然后采用单粒传法(SSD,Single Seed Descent)和株系内混合收获播种(MSD,Multiple Seed Descent),获得了由154个株系构成的重组自交系(RIL,RecombinantInbred Lines)群体.利用Mapmaker/EXP3.0和MapChart 2.0作图软件构建了大豆分子连锁图谱NEAUSRI-MLG(Molecular Linkage Group of Soybean Research Institute in NortheastAgricultural University),总长度为1913.5cM(Centimorgan,厘摩尔根),平均遗传距离为11.89cM,覆盖了20个连锁群,包括161个SSR(Simple Sequence Repeats)位点.每个连锁群长度为0.4 cM-309.5cM,SSR位点数为2-28个.利用Windows QTL Cartographer V2.0进行复合区间作图和农艺性状的QTL(Quantitative Trait Locus)分析,其中包括油分含量、蛋白含量、蛋脂总量、单株荚数、单株粒重、百粒重、株高、生育期、分枝数、主茎节数、结荚习性、花色、茸毛色、叶形、平均叶长和平均叶宽等16个主要农艺性状,最终获得了97个QTL.

目录

文摘

英文文摘

1引言

1.1大豆基因组作图

1.2 QTL定位的基本原理和方法

1.3大豆QTL研究现状

1.3.1农艺性状

1.3.2种子组分性状

1.3.3发芽性状

1.3.4抗病虫性

1.3.5生理性状

1.4分子标记辅助育种

1.4.1亲本选择

1.4.2轮回亲本的恢复

1.4.3早代性状的选择

1.4.4多个性状的选择

1.5本研究的目的与意义

2材料和方法

2.1实验材料

2.2实验方法

2.2.1大豆总DNA的提取

2.2.2 DNA丰度检测

2.2.3 SDS法所需溶液

2.2.4 SSR引物筛选

2.2.5 PCR检测

2.2.6数据统计

2.2.7遗传作图

2.2.8农艺性状的调查

3结果与分析

3.1大豆遗传图谱NEAUSRI-MLG的构建

3.1.1大豆遗传图谱NEAUSRI-MLG的构建

3.1.2NEAUSRI遗传图谱与国内外大豆遗传图谱的比较分析

3.2大豆主要农艺性状的QTL分析

3.2.1 RIL群体主要农艺性状的分离情况

3.2.2大豆重要农艺性状的QTL分析

3.2.3 大豆农艺性状QTLs在大豆遗传图谱NEAUSRI-MLG上分布

4讨论

4.1大豆分子连锁图谱构建

4.2偏分离现象

4.3标记空隙

4.4 QTL定位

4.5 F10代RIL群体中出现的异常DNA变异

5结论

5.1大豆连锁群的构建

5.2 QTLs在连锁群上的分布

5.3 QTL应用性展望

参考文献

攻读硕士学位期间所发表的学术论文

致谢