声明
摘要
1前言
1.2.1水稻冷害定义
1.2.2冷害的种类
1.2.3水稻冷害发生时期
1.2.4水稻冷害特征
1.3水稻转录组测序
1.3.1测序技术
1.3.2水稻参考基因组
1.4转录组在植物耐冷性研究进展
1.5水稻耐冷转录组研究进展
1.6水稻花药研究进展
1.7水稻耐冷响应机制
2材料与方法
2.1试验材料
2.2试验方法
2.2.1田问试验设计
2.2.2转录组测序材料筛选
2.2.3测序材料的处理
2.2.4水稻植株在冷胁迫下的生理指标测定
2.2.5 RNA的制备、文库构建和质控及上机测序
2.2.6测序数据处理、分析和验证
3结果与分析
3.1理想株系的筛选
3.2耐冷株系(E176)和冷敏株系(E186)冷胁迫下生理响应
3.3测序数据统计
3.4两个株系冷处理的转录组基因表达分析
3.5冷胁迫后特异表达基因
3.5.1冷敏株系E186冷处理之后特异表达的基因及GO分析
3.5.2耐冷株系E176冷胁迫特异表达基因及GO分析
3.5.3两个株系冷胁迫后共同特异表达的基因及GO分析
3.6冷胁迫处理前后差异表达基因分析
3.6.1不同材料、处理间差异基因统计
3.6.2两个材料冷胁迫前的差异表达基因GO分析
3.6.3两个材料冷胁迫之后的差异表达基因GO分析
3.6.4耐冷株系E176冷胁迫前后差异表达基因GO分析
3.6.5冷敏株系E186冷胁迫前后差异表达基因GO分析
3.7冷响应特异差异表达基因
3.7.1耐冷株系E176响应冷胁迫特异的差异表达基因分析
3.7.2冷敏株系E186响应冷胁迫特异的差异表达基因分析
3.8通用冷胁迫响应基因
3.9实时荧光定量PCR验证
4讨论
4.1水稻耐冷遗传特性
4.2水稻孕穗期冷害生理响应
4.3水稻株系孕穗期冷胁迫后转录水平响应
4.3.1耐冷株系和冷敏株系冷胁迫后特异表达基因
4.3.2耐冷株系和冷敏株系冷胁迫前后差异表达基因
5结论
致谢
参考文献
附录
攻读硕士学位期间发表的学术论文