脂类代谢相关基因在大鼠肝再生中表达变化和表达模式

摘要

脂类是细胞的结构成份、生物活性成份和重要能源物质。为在基因转录水平了解脂类代谢相关基因在大鼠肝再生中的作用，本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得脂类代谢相关基因，用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况，用比较真、假手术中基因表达的差异性确定肝再生相关基因。初步证实79个参与脂肪酸代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后66～144h)等四个阶段起始表达的基因数为37、5、39和3；基因的总表达次数为83、40、306和94。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达，在不同阶段发挥作用。它们共上调283次，下调200次，分为6种表达方式，表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。它们表达的时间相关性分为0.5和lh、2和4h、6和8h、12h、16h、18和24h、30h、36h、42和96h、48h、54和60h、66和72h、120h、144和168h等14组，表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性。根据上述基因表达变化和表达模式推测，肝再生早早期和中期前列腺素合成增强，早期和中期脂肪酸合成增强，早期、中期和后期白三烯合成增强，早期、后中期和后期脂肪酸分解增强。
　　 34个参与甘油三脂代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为15、7、19和0；基因的总表达次数为30、23、126和40。它们共上调118次，下调78次，分为4种表达方式。它们表达的时间相关性分为0.5和2h、lh、4和8h、6h、12和36h、16和96h、18和48h、24和60h、30和42h、54h、66和72h、120h、144和168h等13组。根据上述基因表达变化和表达模式推测，肝再生早期和前期甘油三脂合成增强；整个肝再生中甘油三脂的分解增强。
　　 97个参与磷脂和鞘脂代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为38、13、58和1；基因的总表达次数为55、34、299和83。它们共上调227次，下调210次，分为8种表达方式。它们表达的时间相关性分为0.5、1和72h、2h、4和6h、8和12h、16和96h、18和24h、30和42h、36h、48和60h、54h、66和168h、120和144h等13组。根据上述基因表达变化和表达模式推测，肝再生早期、前期、中期磷脂酰肌醇代谢和鞘糖脂合成增强，早期和前期鞘磷脂代谢增强，中期磷脂合成增强，整个肝再生中磷脂和鞘糖脂分解减弱。
　　 83个参与类固醇代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为为48、11、33和3；基因的总表达次数为108、63、367和97。它们共上调286次，下调286次，分为11种表达方式。它们表达的时间相关性分为0.5h、lh、2和4h、6和8h、12h、16h、18和24h、30和42h、36h、48h、54和60h、66h、72和120h、96h、144和168h等15组。根据上述基因表达变化和表达模式推测，肝再生早期、中期、后期雄性激素合成和胆汁酸分解增强，肝再生中期、后期胆汁酸合成和胆固醇分解增强，整个肝再生中雌性激素代谢、雄性激素分解和糖皮质激素合成增强，孕酮合成增强、分解减弱，胆固醇合成减弱。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：缩略语表

声明

第一章文献综述

1.肝再生研究进展

2.肝脏中的脂类代谢

3.脂类代谢与肝再生

4.本论文的研究目的和意义

5.参考文献

第二章脂肪酸代谢相关基因在大鼠肝再生中表达变化和表达模式

1.引言

2.材料与方法

2.1再生肝制备

2.2总RNA提取与纯化

2.3 cDNA、cRNA的合成和纯化

2.4 cRNA片断化和芯片检测

2.5芯片检测参数的获取

2.6芯片检测参数的校正

2.7肝再生相关基因的确认

3.结果

3.1脂肪酸代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2脂肪酸代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达及总表达情况

3.3脂肪酸代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4脂肪酸代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式

4.讨论

5.参考文献

第三章甘油三脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达变化和表达模式

1.引言

2.材料与方法

3.结果

3.1甘油三脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2甘油三脂代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达及总表达情况

3.3甘油三脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4甘油三脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式

4.讨论

5.参考文献

第四章磷脂和鞘脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达变化和表达模式

1.引言

2.材料与方法

3.结果

3.1磷脂和鞘脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2磷脂和鞘脂代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达及总表达情况

3.3磷脂和鞘脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4磷脂和鞘脂代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式

4.讨论

5.参考文献

第五章类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达变化和表达模式

1.引言

2.材料与方法

3.结果

3.1类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达及总表达情况

3.3类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式

4.讨论

5.参考文献

总结与结论

1.总结

2.结论

攻读硕士学位期间参加的科研项目和已发表及待发表的论文

致谢