大白菜DH系遗传多样性分析

摘要

本研究首先优化了非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，在此基础上，利用SSR分子标记技术标记了268份大白菜DH材料(3个DH系群体和125份DH材料)，分别构建了3个DH系群体以及125份DH材料的聚类图。主要研究结果如下：
　　 1.非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术的检测效果受到凝胶聚合速度、片段迁移率等多种因素影响。研究比较了凝胶聚合速度及PCR产物在不同浓度凝胶上的检测效果，不同浓度的凝胶是由40％(19:1)和30％(29:1)2种贮存液分别配制4种浓度(5％，7％，9％，11％)。结果表明，在4℃-30℃范围内，凝胶聚合速度随温度的升高而加快；APS保持不变，不同温度下TEMED：APS合适配比也不同：4℃(冬)时，TEMED：APS的合适配比是1:10，25℃(春秋)、30℃(夏)，选择1:20的配比为宜；2种不同贮存液配制的相同浓度凝胶检测效果不同，30％(29:1)优于40％(19:1)。本试验中，由前者配制7％的凝胶上DNA片段分离效果好，带型清晰，分辨率高。
　　 2.选取4份形态学差异大的大白菜DH材料对122对SSR引物进行筛选，共选出12对多态性强的引物。应用所选的12对引物，对所有供试样品进行扩增，然后用30％(29:1)7％非变性聚丙烯酰胺凝胶检测。观察结果，发现SSR引物对不同大白菜DH系群体扩增效率不同。Y360(60份)总共扩增出37条电泳条带，其中29条多态带，多态性比率为78％；Y531(48份)总共扩增出43条带，24条多态带，多态性比率为55.8％；YF05(44份)总共扩增出41条带，36条多态带，多态性比率为87.8％；另外的125份材料总共扩出61条带，53条多态性条带，多态性比率为86.9％。
　　 3.对3个DH系群体分别进行了聚类分析，结果表明：大白菜DH系Y360群体在遗传距离为0.43处分为9个类群，遗传距离范围在0-0.71内；大白菜DH系YF05群体的聚类图上，遗传距离在0.7处分为2个类群，遗传距离范围在0.08-0.81内。第一类群群材料叶面都有茸毛，第二类群都是光叶材料；大白菜DH系Y531群体株系都是天津麻叶类型，在遗传距离为0.41处所有株系分为9个类群，遗传距离范围在0-0.77内。大部分材料分布在聚类图的中上部，只有少数材料零星的散布在上部和中下部。
　　 4.对125份DH材料聚类分析结果为：在遗传距离为0.69处分为7个类群。遗传距离范围在0-0.79内。大部分同一DH系群体的不同株系之间遗传距离较近。所有类群的材料在表型上并无明显的界限。