中国不同地区马铃薯疮痂病菌遗传多样性分析

摘要

马铃薯疮痂病由多种病原链霉菌引起。虽然链霉菌种繁多，在土壤中也很丰富，但也只有少数种类才能致病。植物病原链霉菌已经通过DNA序列相关性，16S rDNA序列和表型特性等手段确定具体种。被世界各地广泛报道的即Streptomyces scabies。 马铃薯疮痂病的发生严重程度依不同地区，同地区不同年份，作物品种的不同而不同。这些差异是由于不同的环境和马铃薯的品种的基因多样性引起的。而对于病原的基因多样性却几乎没有相关报道。 为了测定中国不同地区马铃薯疮痂病菌的遗传多样性，本研究对中国8个省(区)采集分离得到的马铃薯疮痂病菌30株进行16S rDNA序列分析和表型特征分析。所测试菌株中23株可以与Streptomyces scabies(10株)、Streptomyces bobili(5株)、Streptomyces enissocaesilis(3株)、Streptomyces diastatochromogenes(2株)、Streptomyces turgidiscabies(1株)、Streptomyces galilaeus(1株)、Streptomyces setonii(1株)等7个模式菌株归为一类。表明我国马铃薯疮痂病菌存在明显的多样性。其余7个菌株在表型特征上比较近似于Streptomyces bobili模式菌株，但依据16S rDNA序列分析将它们归为Streptomyces galilaeus一类。 本项研究中与S.bobili、S.galilaeus、S.enissocaesilis、S.diastatochromogenes链霉菌种相似的菌株是首次报道为疮痂病病原。 对菌株种类进行分析发现，与Streptomyces scabies相似的菌株来源于黑龙江、内蒙古自治区、四川、山东、甘肃等省；与Streptomyces galilaeus相似的菌株来源于内蒙古自治区；与Streptomyces bobili相似的菌株来源于河北、内蒙古自治区、山西等省；与Streptomyces diastatochromogenes相似的菌株来源于山东、陕西省；与Streptomyces enissocaesilis相似的菌株均来自于陕西省；1株Streptomyces turgidiscabies菌来自陕西；此外，还有来自山东的Streptomyces setonii菌1株。 本研究表明我国马铃薯疮痂病菌存在明显的多样性。同时，本文为研究中国马铃薯疮痂病菌原链霉菌群体多样性奠定了基础。

目录

文摘

英文文摘

声明

1引言

1.1马铃薯疮痂病害介绍

1.2马铃薯疮痂病的病原学

1.3马铃薯疮痂病原的分类方法

1.4研究目的及意义

2材料与方法

2.1病原菌的分离纯化及致病性检测

2.1.1供试菌种

2.1.2供试培养基

2.1.3主要仪器设备和试剂

2.1.4链霉菌菌株的分离纯化及孢悬液的制备

2.1.5菌株的致病性测定

2.2表型特征测试

2.2.1供试菌株

2.2.2供试培养基

2.2.3主要器材和试剂

2.2.4形态及培养特征观察方法

2.2.5生理生化特征观察

2.2.6聚类分析

2.3 16S rDNA序列的测定

2.3.1供试菌株

2.3.2供试培养基

2.3.3主要仪器设备和试剂

2.3.4 16S rDNA序列的扩增

2.3.5 PCR产物纯化

2.3.6 16S rDNA PCR产物的克隆

2.3.7 16S rDNA序列的测定

2.3.8构建系统发育树

2.4菌株的地域分布特点分析

3结果与分析

3.1病原菌的分离纯化及致病性检测结果

3.2表型特征结果

3.2.1形态及培养特征观察结果

3.2.2菌株的生理生化特性结果

3.2.3聚类分析结果

3.2.4菌株的地域分布特点分析

3.3 16S rDNA序列的测定

3.3.1基因组提取和16S rDNA扩增结果

3.3.2多序列比对、系统发育树构建及聚类分析结果

3.3.3菌株的地域分布特点分析

4讨论

4.1马铃薯疮痂病原菌多样性

4.2马铃薯疮痂病菌分类方法

4.3 16S rDNA 应用

4.4菌株的地域分布特点分析

4.5菌种描述

4.6下一步工作

5结论

参考文献

在读期间发表的论文

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致谢