深县猪保种群性能测定及群体遗传结构微卫星标记研究

摘要

深县猪作为河北省曾经的地方品种深受当地群众的喜爱，但受国外引进瘦肉型猪种的冲击，在2004年国家地方品种普查时，因数量少未列入国家地方品种志。2009年，辛集市正农牧业有限公司开始从民间搜集深县猪，经过5年的搜集、挖掘、提纯和复壮，深县猪群体已初具规模。为了解和掌握深县猪群体的性能现状及群体的遗传结构，特开展本研究。本研究共分两部分:一是深县猪保种群性能测定;二是深县猪保种群群体遗传结构微卫星标记研究。
　　试验一:通过在河北省内搜集组建、最后落户于辛集市正农牧业有限公司的深县猪群进行研究。记录产仔数、初生重、断奶重等繁殖性能指标;体重、体尺等生长性能指标;瘦肉率、粗蛋白、粗脂肪、PH、滴水损失、肉色等屠宰性能指标;肌纤维粗细、密度等肉质指标，对深县猪的体型外貌、生长性能、屠宰性能及肉质特性进行了分析测定。目前，深县猪保种群公猪24头，母猪147头。1胎窝产仔数9.23头，仔猪初生重0.94kg，断奶重5.57kg，眼肌面积21.20cm2，瘦肉率35.08％，肉色3.5，大理石花纹4，PH245.95，肌内脂肪9.37％。单根肌纤维横截面面积3498.333μm2，肌纤维密度256.25根数/m2。与品种志记载的进行对比，深县猪基本恢复到原来的水平。
　　试验二:利用微卫星DNA标记技术，对深县猪70个种猪个体，5个家系进行测定。聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测7个微卫星位点(联合国粮农组织(FAO)联合推荐的23个中，选用7个）的遗传多样性，测得各个位点在家系中基因频率、基因型频率、杂合度、多态信息含量、遗传距离等数据。深县猪现有保种群体在微卫星位点S0155、SW240、SW632、S0178、SW911、S0068、SW857上共检测到53个等位基因，平均每个位点上的等位基因数为7.5714个，其中SW240最多，含有10个;SW911最少，含有5个。根据数据分析，可以得出:在不同的家系之间的同一个微卫星位点上的等位基因频率和等位基因数也不相同，以S0155为例，在01家系中有6个等位基因，在03家系中有5个等位基因，在05家系中有5个等位基因，在07家系中有4个等位基因，在09家系中有2个等位基因，不同家系中的等位基因数的不同，说明各个品系具有不同的遗传基础。此外，还分析得到，家系在位点上的特征性条带，可以作为群体特定的遗传标记。SW240位点上的特异条带是07家系的94bp条带和03家系的116bp条带;SW632位点上的特异条带是03家系的174bp条带;S0178位点上的特异条带是07家系的138bp条带;SW911位点上的特异条带是07家系的163bp条带;S0068位点上的特异条带是05家系的238bp条带;SW857位点上的特异条带是156bp条带。深县猪5个家系间的平均位点杂合度范围是0.5873-0.7682，平均多态信息含量范围是0.5309-0.7514，数据表明深县猪群体有较高的遗传多样性。根据Nei氏标准遗传距离了解家系间的遗传关系，01家系、03家系、05家系间的遗传距离较近，在生产实践中常用。

目录

声明

摘要

引言

2 材料与方法

2．1 试验材料

2．1．1 试验材料来源及样品的采集

2．1．2 试验试剂

2．1．3 仪器设备

2．1．4 试验用品的配制

2．1．5 微卫星引物的确定与合成

2．2 试验方法

2．2．1 保种群建立

2．2．2 屠宰测定

2．2．3 肉质的测定

2．2．4 切片的制作—肉质石蜡切片制做法

2．2．5 DNA的提取

2．2．6 DNA浓度的检测

2．2．7 PCR扩增

2．2．8 琼脂糖凝胶的配制

2．2．9 PCR产物的检测

2．3 数据的统计分析

2．3．1 深县猪群体遗传结构分析

3 结果与分析

3．1 保种群系谱及性能测定

3．1．1 公猪系谱

3．1．2 体重体尺测定结果

3．1．3 繁殖性能

3．1．4 生长育肥性状的测定

3．1．5 生长猪的耐粗饲能力得以保持

3．1．6 二世代猪群生长育肥猪的胴体及肉质性状

3．1．7 切片的结果

3．1．8 深县猪挖掘、提纯、复壮后的体型外貌和生产性能与品种志记载对比

3．2 DNA提取结果及引物适宜退火温度的检测

3．2．1 DNA提取的检测

3．2．2 引物的梯度PCR试验

3．3 PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测

3．4 深县猪群体遗传结构分析

3．4．1 等位基因和等位基因型频率的计算

3．4．2 深县猪杂合度分析

3．4．3 多态信息含量(Polymorphism Information Content，PIC)

3．4．4 深县猪5个家系之间的Nei氏遗传距离

4 讨论

4．1 深县猪保种群的建立

4．2 深县猪的肉质性状

4．3 动物组织的采样、保存及DNA的提取

4．4 深县猪家系间的遗传关系

4．4．1 深县猪基因频率与基因型频率

4．4．2 卡方检验

4．4．3 深县猪群体杂合度

4．4．4 深县猪多态信息含量(Polymorphism Information Content，PIC)

4．4．5 深县猪群体间的遗传距离

4．5 存在的问题及展望

4．5．1 存在的问题

4．5．2 展望

5 结论

参考文献

在读期间发表的学术论文

作者简介

致谢