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东海典型有害赤潮藻塔玛亚历山大藻杀藻细菌的研究及南海可培养细菌多样性分析及几丁质降解菌研究

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第一章塔玛亚历山大藻杀藻细菌的研究

第二章杀藻菌基因组文库的构建

第三章南海可培养细菌多样性分析

第四章南海几丁质降解菌的分离及特性研究

参考文献

附录

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摘要

本论文分离并鉴定了9株塔玛亚历山大藻杀藻细菌,研究了其杀藻方式,构建了其中5株杀藻细菌的基因组文库;从南海水样和沉积物样品中进行了细菌的分离和鉴定,并对其中两株几丁质降解菌的特性进行了研究;获得主要结果如下:
   从东海赤潮高发区分离并筛选到9株塔玛亚历山大藻杀藻菌,16S rDNA序列分析表明它们分别属于假交替单胞菌属(SP31、SP44)、交替单胞菌属(DH12、DH46)、Idiomarina属(SP96)、弧菌属(DH47、DH51)、盐单胞菌属(DH74、DH77)。对它们的杀藻方式研究表明,这些杀藻细菌都是通过间接方式杀藻,即通过产生胞外杀藻活性物质来杀死藻细胞,直接加入细菌细胞并不产生杀藻活性。大多数这些杀藻细菌产生的杀藻物质具有较高的热稳定性。
   分别提取了5株杀藻细菌(DH46、DH51、DH77、SP48、SP96)的基因组DNA,采用pUC19质粒作为载体,分别构建了这五株杀藻细菌的基因组文库,文库平均插入片段大约3-7 kb,克隆子约5-7×103个,覆盖率达到99%。
   从南海水样和沉积物中分离到细菌169株,RFLP分析得到55个谱型,经测序后结果表明所分离到得细菌中Proteobacteria占据优势(78.2%),其中γ-Proteobacteria占63.6%,α-Proteobacteria占14.5%;Firmicutes占21.8%。这些细菌分属于9科,15属,35种。其中菌株SCSWE24与模式菌株同源性最高仅92%,可能是一株新种。
   从南海海域水样和沉积物中分离并筛选到两株几丁质降解菌,分别为SCSS04和SCSWE13。16S rDNA序列分析结果表明,菌株SCSS04属于芽孢杆菌属,菌株SCSWE13属于弧菌属。两株菌几丁质酶的产生均需要几丁质的诱导,并在富营养培养基中产酶量较高。菌株SCSS04在培养第9天产酶量达到最高,所产生的几丁质酶最适反应温度为40~50℃。菌株SCSWE13属于低温酶,在培养第7天产酶量达到最高,所产生的几丁质酶最适反应温度为20~28℃。

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