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小鼠急性中耳炎模型中中耳与内耳差异基因的筛选及基因网络分析

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英汉缩略语名词对照

前言

第一部分 小鼠急性未分型流感嗜血杆菌中耳炎差异基因的互作网络特征分析

1 材料与方法

2 结果

3 讨论

第二部分 小鼠急性肺炎链球菌中耳炎模型中中耳与内耳差异基因的筛选

1 实验材料

2 实验方法

3 实验结果

4 讨论

全文总结

参考文献

文献综述:急性中耳炎基因易感性研究进展

致谢

攻读学位期间发表的学术论文

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摘要

背景:
  中耳炎是儿童时期最常见的感染性疾病之一,多种基因均参与其发病过程。目前已有关于小鼠中耳炎的基因芯片研究,但都是基于流感嗜血杆菌所致的中耳炎,对肺炎链球菌引起的中耳炎的基因表达谱芯片研究至今尚未开展过。并且目前对中耳炎研究主要倾向于传统单基因方面,显然已不能满足当前系统生物学研究的需要。
  因此,本研究一方面绘制出流感嗜血杆菌所致中耳炎的差异基因互作网络图,筛选出其主要网络中心节点,另一方面研究肺炎链球菌性小鼠急性中耳炎时所涉及的基因改变。
  方法:
  用生物信息学软件对GEO数据库中已有流感嗜血杆菌中耳炎相关基因芯片原始数据进行分析,绘制差异基因网络;用鼓膜穿刺法建立小鼠肺炎链球菌中耳炎模型,并进行mRNA表达谱生物芯片分析,筛选中耳与内耳的差异基因。
  结果:
  流感嗜血杆菌中耳炎表达谱芯片(GSE66141)经STRING在线工具、Cytoscape软件分析后得到其基因网络图;肺炎链球菌中耳炎表达谱芯片结果显示中耳中702个基因上调,250个基因下调;内耳中上调基因140个,下调基因171个。
  结论:
  本研究的结果可能为中耳炎的分子机制提供更好的了解。

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