1 绪 论
1.1 研究背景
1.1.1 中华按蚊的危害及其防治
1.1.2 昆虫的嗅觉感受机制
1.1.3基于转录组的蚊虫化感基因表达谱研究现状
1.2研究目的与意义
1.3研究主要内容
1.3.1 中华按蚊触角、喙、下颚须和整蚊转录组的测序、组装和拼接
1.3.2 中华按蚊触角、喙、下颚须和整蚊之间基因的差异表达分析
1.3.3 中华按蚊触角、喙、下颚须和整蚊之间的化感基因差异分析
1.3.4 用qPCR对中华按蚊进行组织表达验证
1.4 技术路线
2 中华按蚊化感组织转录组的测序及质量评估
2.1实验材料
2.1.1 供试蚊虫
2.1.2 实验试剂及设备
2.2实验方法
2.2.1取样方法
2.2.2 总RNA的提取及质量检测
2.2.3 cDNA文库的构建与高通量测序
2.2.4 转录本的拼接与组装
2.2.5 基因表达水平的定量
2.2.6 RNA-seq整体质量评估
2.3结果与分析
2.3.1 取样情况
2.3.2 总RNA提取及质量检测
2.3.3 中华按蚊测序数据产量的统计及质量控制
2.3.4 参考序列比对分析
2.3.5 基因表达水平的定量
2.3.6 RNA-Seq整体质量评估
2.4 总结与讨论
3 中华按蚊化感组织基因的差异表达分析
3.1 实验材料
3.1.1 实验数据
3.1.2 实验软件
3.2 实验方法
3.2.1 差异表达分析
3.2.2 差异基因GO富集分析
3.2.3 差异基因KEGG富集分析
3.3 结果与分析
3.3.1 差异基因的筛选结果
3.3.2 差异基因表达情况
3.3.3 差异基因的聚类分析
3.3.4 差异基因GO富集分析
3.3.5 差异基因KEGG富集分析
3.4 总结与讨论
4 中华按蚊化学感受基因的注释和表达谱分析
4.1 材料与方法
4.1.1 中华按蚊化学感受基因的信息
4.1.2 转录组中化学感受相关基因的注释
4.1.3 转录组中化学感受相关基因的差异表达分析
4.2 结果与分析
4.2.1 化感基因的注释结果
4.2.2 化感基因的表达水平分析
4.2.3 筛选差异化感基因
4.2.4 差异化感基因的表达丰度分析
4.2.5 差异化感基因的GO注释
4.3 总结与讨论
5 中华按蚊嗅觉器官化感基因的组织表达验证
5.1 材料与方法
5.1.1 中华按蚊及中华按蚊组织收集
5.1.2 主要试剂及仪器设备
5.1.3 中华按蚊触角、喙、下颚须和整蚊总RNA的提取
5.1.4 中华按蚊触角、喙、下颚须和整蚊cDNA第一链的合成
5.1.5 引物设计
5.1.6 PCR反应体系及反应程序
5.2 结果与分析
5.2.1 中华按蚊化学感受相关基因的组织表达量分析
5.3讨论
6 结论
参考文献
附录A:攻读硕士学位期间发表论文及科研情况
附录B:测序错误率分布图
附录C:GC含量分布图
附录D:原始数据组成
附录E:不同性别之间的差异基因
附录F:注释结果
附录G:不同性别之间的差异化感基因
致谢
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