陆地棉SSR标记遗传图谱构建与纤维品质性状QTL定位

摘要

棉花是首要的天然纤维作物，同时也是重要的油料和蛋白来源作物。棉花栽培种包括亚洲棉、草棉、海岛棉和陆地棉。陆地棉提供了95％以上的原棉。但与海岛棉相比，陆地棉的纤维品质较差。随着人们生活水平的提高和纺织工业的飞速发展，陆地棉纤维品质质量越来越不能满足人们的需求。
　　同时改良棉花产量和纤维品质一直是育种家的重要目标。由于棉花产量和纤维品质性状是由多基因控制的数量性状，且棉花产量和纤维品质之间存在负相关，使用传统育种方法难以实现棉花产量和纤维品质之间的同步改良。在构建相对饱和的分子标记遗传连锁图谱和定位目标性状QTL的基础上，利用分子标记辅助选择，可以显著提高选择效率。
　　本研究利用陆地棉优质品种渝棉1号与高油品系M11杂交，建立(渝棉1号×M11) F2群体，在构建遗传连锁图谱的基础上，对纤维品质性状QTL进行定位。其研究结果如下:
　　1.引物多态性分析与群体标记基因型检测
　　利用12443对SSR引物对亲本渝棉1号和M11之间进行多态性筛选，共获得多态性引物663对，多态性引物占5.3％。利用多态性引物检测F2群体基因型，其中3对引物产生两个位点，共获得666个多态性位点。107个位点是显性标记，559个是共显性标记。
　　2.陆地棉遗传图谱的构建
　　利用JionMap4.0对666个位点进行遗传连锁分析，构建一张重组总长度为3096.9cM的遗传图谱。图谱包含614个标记、79个连锁群，79个连锁群定位到26条染色体，标记间的平均距离为5.04cM。
　　3.纤维品质性状定位
　　利用（渝棉1号×M11）F2、 F2∶3和F2∶4世代的纤维品质性状数据，一共检测到54个QTL，包括37个显著性QTL和17个可能性QTL。12个纤维长度QTL，解释表型变异4.7-40.0％。15个纤维整齐度QTL，其中一个QTL在两个世代中被检测到。解释表型变异3.4-42.8％。13个纤维比强度QTL，解释表型变异3.8-36.5％。9个纤维马克隆值QTL，解释表型变异6.6-36.7％。5个纤维伸长率QTL，解释表型变异3.3-15.8％。

目录

声明

论文说明

摘要

第1章 文献综述

1．1 我国棉花纤维品质现状

1．2 我国棉花育种中存在的问题

1．3 代表性的DNA分子标记

1．3．1 RFLP限制性片段长度多态性标记

1．3．2 SSR微卫星标记

1．3．3 RAPD随机扩增多态性标记

1．3．4 SRAP相关序列扩增多态性标记

1．3．5 AFLP扩增片段长度多态性标记

1．4 棉花遗传图谱的研究进展

1．4．1 二倍体棉花遗传图谱的研究概况

1．4．2 陆地棉种内遗传连锁图谱

1．4．3 海岛棉与陆地棉种间遗传连锁图谱

1．4．4 棉花遗传图谱研究存在的问题

1．5 棉花纤维品质性状的QTL定位

1．5．1 QTL定位的原理

1．5．2 棉花纤维品质性状QTL定位的研究进展

第2章 引言

2．1 目的意义

2．2 技术路线

第3章 材料与方法

3．1 实验材料

3．2 主要仪器设备

3．3 棉花基因组DNA的提取

3．3．1 提取试剂

3．3．2 棉花基因组DNA提取步骤

3．4 SSR标记检测

3．4．1 SSR反应体系的建立

3．4．2 SSR扩增产物的检测

3．5 陆地棉种内遗传连锁图谱的构建

3．5．1 筛选亲本间多态性和检测群体基因型

3．5．2 遗传连锁图谱的构建

3．6 纤维品质性状QTL分析

第4章 结果与分析

4．1 引物多态性分析及群体基因型检测

4．2 遗传图谱的构建

4．3 亲本及群体纤维品质表型分析

4．4 纤维品质性状定位

第5章 讨论

5．1 亲本间的标记多态性

5．2 遗传图谱的比较

5．3 环境对纤维品质QTL定位的影响

5．4 QTL等位基因来源

第6章 结论

6．1 作图亲本的多态性

6．2 陆地棉遗传连锁图谱构建

6．3 纤维品质QTL的分析

参考文献

致谢

发表论文和参加科研情况