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针对survivin基因不同区域的RNAi实验研究

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1 前言

1.1 研究背景

1.2 研究目的

1.3 研究内容

2 材料与试剂

2.1 实验材料

2.2 实验方法

3 结果

3.1 样本中总RNA鉴定

3.2 实时荧光定量PCR检测mRNA和hnRNA的表达

3.5 总蛋白定量

3.6Western Blot检测细胞总蛋白中Survivin的表达

4 讨论

5.小结

参考文献

综述:肿瘤特异性启动子的研究及其应用

致谢

附录一 缩略词表

附录二 在读硕士期间发表的论文

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摘要

【目的】 根据RNAi技术,设计并合成针对survivin基因的外显子、内含子及外显子连接处的siRNA,转染至人宫颈癌细胞中(Hela),干扰survivn基因表达。从mRNA、hnRNA和蛋白质水平观察不同位点的干扰序列的沉默基因的效果,从转录水平基因沉默(tran-scriptional gene silencing,TGS)和转录后沉默(post-transcriptional Gene Silencing,PTGS)初步探讨不同序列、不同区域的siRNA和RNAi机制。 【方法】 根据siRNA的设计原则,分别设计并合成针对外显子的2组siRNA、针对外显子连接处的2组siRNA及针对内含子的2组siRNA,同时再合成1组作为阴性对照的siRNA,分别转染至Hela细胞中。通过实时荧光定量PCR在mRNA和hnRNA水平检测survivin基因的转录情况,再进一步通过western blot在蛋白质水平检测基因的表达情况,分三个时间段检测蛋白表达的差异。 【结果】 成功设计并合成针对survivin基因的外显子、内含子及外显子连接处的六组siRNA,转染至HeLa细胞中。与空白对照组相比,在RNA的水平上,各组均出现不同程度的抑制效果(P<0.05);在蛋白质水平上,24h后有部分组别出现抑制,48h的时候全部呈现抑制状态(P<0.05),72h时抑制效果出现不同程度的减弱。其中,外显子连接处的抑制效果最为明显,并且持续时间较长。 【结论】 针对基因的mRNA和hnRNA设计的siRNA是可以沉默靶基因的,即RNAi可以作用于基因的编码区和非编码区。其中,外显子连接处的干扰效果优于其他区域,这可能与RNAi的机制TGS、PTGS机制相关。

著录项

  • 作者

    王法;

  • 作者单位

    广东医学院;

  • 授予单位 广东医学院;
  • 学科 生物化学与分子生物学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 黄迪南,侯敢;
  • 年度 2016
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类 肿瘤学;
  • 关键词

    survivin基因; 区域; RNAi;

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