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中英文缩略词表
第1章 文献综述
1.1犏牛雄性不育研究进展
1.1.1犏牛组织形态学和细胞遗传学研究
1.1.2犏牛分子生物学研究
1.1.3 精子发生过程与雄性不育
1.2 Y染色体与雄性生殖
1.2.1 Y染色体结构
1.2.2 Y染色体功能
1.2.3 Y染色体与公牛雄性不育
1.3 DNA甲基化与雄性生殖
1.3.1 DNA甲基化
1.3.2 DNA甲基化功能
1.3.3 DNA甲基化与犏牛雄性不育
第2章 引言
2.1 研究目的和意义
2.2 研究内容
第3章 材料与方法
3.1 试验材料
3.1.1 试验样本
3.1.2 主要仪器
3.1.3 主要试剂及耗材
3.1.4 相关数据库及分析软件
3.2 试验方法
3.2.1 石蜡切片
3.2.3 睾丸组织总DNA提取
3.2.5 Y染色体和线粒体来源的检测
3.2.6进化树的构建
3.2.7 引物设计
3.2.8 常规PCR
3.2.9 实时荧光定量PCR
3.2.10 抗体的制备
3.2.11 Western-Blot检测
3.2.12 WGBS测序分析
3.3 数据分析
3.3.1 Real-time PCR
3.3.2 Western-Blot
第4章 结果与分析
4.1普通牛、牦牛和犏牛睾丸组织切片分析
4.2 普通牛、牦牛和犏牛Y染色体及线粒体单倍型分析
4.3检测cDNA中是否有基因组DNA污染
4.4普通牛、牦牛和犏牛睾丸组织X-退化区基因表达模式分析
4.4.1普通牛、牦牛和犏牛X-退化区基因雄性特异性分析
4.4.2普通牛、牦牛和犏牛X-退化区基因组织特异性表达分析
4.4.3普通牛、牦牛和犏牛X-退化区基因序列多态性分析
4.4.4 普通牛、牦牛和犏牛X-退化区基因mRNA表达差异分析
4.5普通牛、牦牛和犏牛睾丸组织Y染色体多拷贝基因表达模式分析
4.5.1 Y染色体多拷贝基因的序列分析
4.5.2 Y染色体多拷贝基因引物的雄性特异性和类型特异性分析
4.5.3 牦牛Y染色体中缺失TSPY3-T2类型序列
4.5.4普通牛、牦牛和犏牛多拷贝基因组织特异性表达分析
4.5.5普通牛、牦牛和犏牛多拷贝基因mRNA表达量分析
4.5.6普通牛、牦牛和犏牛多拷贝基因CNV分析
4.5.7普通牛、牦牛和犏牛睾丸组织PRAMEY-T3、PRAMEY-T4蛋白表达量分析
4.6普通牛和犏牛睾丸组织全基因组DNA甲基化差异分析
4.6.1 课题组前期RNA-seq结果
4.6.2基因组测序深度分析
4.6.3甲基化C位点比例分析
4.6.4染色体甲基化密度分布分析
4.6.5普通牛和犏牛差异甲基化区域（DMR）分析
4.6.6普通牛和犏牛差异甲基化区域相关基因GO通路分析
4.6.7启动子超甲基化抑制piRNA生成通路基因表达
4.6.8 启动子超甲基化抑制精子发生和联会基因的表达
第5章 讨论
5.1 Y染色体X-退化区基因表达与精子发生
5.2 牦牛和普通牛Y染色体MSY区域多拷贝基因结构存在差异
5.3 Y染色体MSY区域多拷贝基因表达与精子发生
5.4 DNA甲基化与精子发生
5.5 piRNA生成通路基因与精子发生
第6章 结论
参考文献
致谢
攻读硕士期间主持项目及发表的文章
