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甘肃省荞麦种质资源SSR遗传多样性分析

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第一章文献综述

1遗传多样性研究的方法、途径和意义

1.1遗传多样性的方法

1.2遗传多样性的研究意义

2主要遗传标记

2.1形态标记(Morphologic Marker)

2.2细胞学标记(Cytological Marker)

2.3生化标记(Biochemical Marker)

2.4 DNA标记(DNA Marker)

3遗传多样性研究在种质资源研究中的应用

3.1核心种质构建与正确的种质保存和利用策略的制定

3.2种质资源的亲缘关系与分类研究

3.3种质创新

3.4杂种优势机理的研究

4遗传多样性分析

4.1遗传多样性通常所用指标及方法

5统计方法

5.1聚类分析

5.2主成分分析

5.3判别分析

6荞麦种质资源的起源、价值及遗传多样性研究

6.1荞麦种质资源的起源

6.2荞麦主要的农艺性状概述

6.3荞麦的价值

6.4荞麦资源的收集保存

6.5荞麦种质遗传多样性研究进展荞麦种质遗传多样性研究进展

7本研究的意义及目标

第二章甘肃省荞麦种质资源SSR遗传多样性分析

1材料与方法

1.1实验材料

1.2实验方法

1.4聚丙烯酰胺凝胶电泳检测

1.5数据分析方法

2结果与分析

2.1 DNA的提取、纯化及浓度的鉴定

2.2 PCR反应体系的优化

2.3 SSR标记的多态性分析

2.4荞麦种质的遗传相似程度

2.5荞麦种质的聚类分析

3讨论

3.1 SSR标记多态性及适用性

3.2荞麦基因组的提取

3.3甘肃荞麦品种间和品种内的遗传多样性

3.4聚类比较

3.5 SSR技术在荞麦品种资源研究中的应用探讨

4结论

致谢

参考文献

作者简历

导师简介

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摘要

荞麦(Fagopyrum spp.)是一种重要的粮、药、饲兼用作物。本研究旨在探讨甘肃省荞麦栽培种间和种内的遗传多样性,为荞麦种质资源的保护和利用提供科学依据。 本研究首次在甘肃利用SSR分子标记技术和相关的统计方法对甘肃主要的甜荞种质资源的遗传多样性进行了科学分析。 得出了如下主要结果:建立了一种适合于SSR反应技术体系。用5对SSR引物对12份甜荞种质问和种内的240单株基因组DNA进行了扩增分析。12份甜荞种质间获得24条带,其中多态性带15条,多态性百分率平均为62.5%;12份甜荞种质内的240单株基因组DNA扩增共获得104条带,其中多态性带33条,多态性百分率平均为31.7%。同时,种间多态性信息指数大于种内多态性信息指数,表明甘肃荞麦种间遗传多样性高于种内遗传多样性。对不同荞麦种间进行了聚类,结果表明:12份供试资源可聚为3类,第Ⅰ类是06鉴-7和06鉴-13;第Ⅱ类是06选-83,01-039,2000-25,定96-H-2和01-048;第Ⅲ类是平荞2号,01-034,01-028,06鉴-11和06鉴-1。同时对12份供试资源的240份单株样品通过获得的数据进行了聚类,其结果与种间的聚类大体上基本相同。有些样品单株本应聚在所在的类群,但实际上没有聚在所在类群,这说明甜荞种质内存在一定的遗传变异。Nei氏相似系数(1983)分析表明,甜荞种质间平均相似系数为0.863,种质内平均相似系数为0.897,同样表明甘肃甜荞种间比种内具有较为丰富的多样性。综上所述,通过应用SSR技术研究甘肃荞麦资源的遗传多样性,表明供试养麦材料间和材料内存在适度的遗传变异和较高的相似程度。

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