东亚部分马群体线粒体Cytb基因序列及分子系统学研究

摘要

本文通过对马的线粒体细胞色素b(cytb)基因全序列的遗传变异分析，来探讨中国家马8个群体、普氏野马、韩国cheju马和日本家马之间的亲缘关系和遗传多样性。 运用分子生物学软件分析本研究测定蒙古马、普氏野马A系和B系线粒体cytb基因全序列和从Genbank中获得的9个群体37条序列，总共12个群体的DNA多态性，并构建系统发生树。Cytb基因序列变异分析表明：1)马的cytb基因全序列长度一致为1，140bp，无插入和缺失；2)Cytb全序列含52个核苷酸变异位点，33个简约信息位点，其中处于密码子第三位的变异最大，第一位和第二位碱基的变异相对较小；3)Cytb基因全序列中碱基组成富含A，T，A+T含量为54.6﹪，且第二位点A，T偏向性更加明显，达到61.5﹪。所有群体在第三位点上碱基G的含量极少，平均仅为5.2﹪，且在种间表现出4.7﹪～5.5﹪的差异。Cytb基因在密码子使用上具有明显的偏向性。4)核苷酸转换远远高于颠换(转换/颠换=14.2)，转换主要为C→T、T→C、A→G、G→A，颠换很少发生，碱基替换大都发生在密码子第三位，基因序列中的转换与颠换都未饱和；5)按照cytb蛋白结构模型，cytb基因全序列可分为三个功能区，核苷酸变异多发生在跨膜区。Cytb基因的3'末端比5'末端携带有更多的系统学信息。对东亚的12个马群体进行系统发育分析，使用3种常用的建树方法NJ法、UPGMA法和MP法，所构建的分子树的拓扑结构基本一致。分析表明：1)中国家马具有多个起源或经过多次驯化。2)普氏野马与蒙古马有很近的亲缘关系，推测二者是具有共同祖先的亲戚。3)韩国cheju马与三河马的亲缘关系较近。日本家马与乌珠穆沁马的亲缘关系较近。

目录

文摘

英文文摘

第一部分文献综述

第二部分材料和方法

第三部分结果分析与讨论

致谢

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