線虫の初期胚発生の多重統合関係ネットワーク表現

摘要

ここでは，線虫Caenorhabditis elegansの初期胚発生を記述する複数の概念構造を統合した記述について述べる．それぞれの概念構造は，記述の粒度と視点が異なり，直感的には階層関係にあると捉えられる．近年の生物実験手法の進展によって，一度に大量のデータを生成するハイスループット手法が用いられている．多くの場合，対象とする生物種のゲノム全体についてデータが得られ，これは多くても数種類の要素（例えば遺伝子）のみについてのデータを解析する手法とは根本的に異なる分析手順が必要だと考えられる．例えば，本研究の対象とする線虫C．elegansの場合，遺伝子数は20,532個である．ゲノムの全遺伝子の発現量を計測するマイクロアレイ実験では，複数の条件で実験を実施し，さらには同条件につき数回行なうため，10万以上のデータが一度に生成される．条件数の増加や時系列データを計測する場合，データ数はさらに増える．