遺伝子ネットワークとGene Ontology の統合可視化の一手法

摘要

近年，様々な遺伝子関連情報が明らかになってきたが，未だに機能のわからない遺伝子も多く存在している．この機能解明に向けて，遺伝子をノード，遺伝子間の相互作用をエッジとする遺伝子ネットワークが構築され，遺伝子機能発見に役立てられている．しかし，遺伝子ネットワークのノードとエッジの数は非常に膨大であり，そのまま可視化したのでは機能と相互作用の関係性を視認しづらい．そこで本報告では，可視化手法FRUITSNet[1]を用いて，遺伝子機能情報であるGO（Gene Ontology）[2]と遺伝子ネットワークの統合可視化手法を提案する．GO とは，種や現象ごとにこれまで独立につけられていた遺伝子情報の名称や定義を，共通の語彙を使用して定義し，有効活用できるようにした概念体系のことである．GO によって定義された用語はGO タームと呼ばれる．このGOによって定義された機能情報を，遺伝子ネットワークと同時に可視化することで，遺伝子の未発見の機能や関係性を推測しやすくし，生物学の研究分野で実験を行う方針をたてる支援や，遺伝病などの原因究明に繋がるようになるのではないかと考えられる．