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笹侵食湿地土壌において嫌気酢酸酸化を担う微生物の多様性

机译:竹侵蚀湿地土壤中负责厌氧乙酸氧化的微生物多样性

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摘要

湿地は主要な大気メタン放出源のひとつであるが、笹に侵食された区域ではメタン生成が抑制される。酢酸は嫌気有機物分解過程において重要な中間代謝産物であり、そのほとhどは酢酸資化性のメタン生成菌により利用される。一方で、一部の酢酸は二酸化炭素へ嫌気的に酸化されることが示唆される。この反応を担う嫌気酢酸酸化微生物は、酢酸資化性メタン生成菌と基質競合関係にあり、メタンの放出を抑制すると考えられている。しかしながら、吸エルゴン反応である嫌気酢酸酸化(ΔG~(0,) = +104 KJ/mol)を担う微生物の系統はほとhど分かっていない。我々が開発した超高感度rRNA-SIP(Stable Isotope Probing)は、炭素の安定同位体(~(13)C)で標識された基質を環境試料に添加·培養し、同位体標識rRNAを密度勾配超遠心で分離し、それを次世代シータエンサーにより大規模に解析することで、同位体基質を分解して取り込む微生物を高感度に同定する手法である。本研究では、超高感度rRNA-SIPによりメタン生成菌と基質競合する嫌気酢酸酸化微生物を同定した。
机译:湿地是大气中甲烷排放的主要来源之一,但在竹子侵蚀地区甲烷的产生受到抑制。乙酸是厌氧有机物分解过程中重要的中间代谢产物,大部分被利用乙酸的产甲烷菌利用。另一方面,建议某些乙酸被厌氧氧化为二氧化碳。负责该反应的厌氧乙酸氧化微生物与利用乙酸的产甲烷菌具有底物竞争关系,并被认为抑制了甲烷的释放。然而,作为负离子反应的负责厌氧乙酸氧化的微生物菌株(ΔG〜(0,)= + 104KJ / mol)几乎是未知的。我们开发的超灵敏rRNA-SIP(稳定同位素探测)是同位素标记的rRNA的密度梯度,方法是在环境样品中添加并培养被碳(〜(13)C)稳定同位素标记的底物,并对其进行培养。这是一种通过超速离心分离并通过下一代Thetaenser对其进行大规模分析,从而以高灵敏度识别分解并吸收同位素底物的微生物的方法。在这项研究中,我们确定了厌氧乙酸盐氧化微生物,可通过超灵敏rRNA-SIP与产甲烷菌竞争。

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