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Feature genes selection and classification with SVM for microarray data of lung tissue

机译:具有SVM的特征基因选择和分类,用于肺组织的微阵列数据

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摘要

Microarray analysis had been became a widely used tool for disease detection. It used tens of thousands of genes that would be a huge computational problem. The proposed approach applied feature genes selection and classification with support vector machine (SVM) for the microarray data of lung tissue. Based on the proposed approach, feature genes could be finding out according to the epsilon-support vector regression (epsilon-SVR) and selection ranked genes from each class. Moreover, applied multi-class support vector classification (multi-class SVC), cross-validation and parameter search methods to acquire great prediction classification accuracy and less computing time. That is, the effective dimension reduction for finding out feature genes is an important process in the proposed approach. The results shows the feature genes which our purposed approach finding out could acquire great prediction classification accuracy.
机译:微阵列分析已成为疾病检测的广泛使用的工具。 它使用了数万个基因,这将是一个巨大的计算问题。 所提出的方法将特征基因选择和分类应用于肺组织的微阵列数据的支持向量机(SVM)。 基于所提出的方法,特征基因可以根据ε-支持载体回归(EPSILON-SVR)和从每个类的选择排名的基因来发现。 此外,应用多级支持向量分类(多类SVC),交叉验证和参数搜索方法,以获取伟大的预测分类精度和更少的计算时间。 也就是说,寻找特征基因的有效维度降低是所提出的方法的重要过程。 结果表明,我们所用方法发现的特征基因可以获得伟大的预测分类准确性。

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