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Efficient Indexes for Jumbled Pattern Matching with Constant-Sized Alphabet

机译:恒定大小字母的混杂模式匹配的有效索引

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摘要

We introduce efficient data structures for an indexing problem in non-standard stringology - jumbled pattern matching. Moosa and Rahman [J. Discr. Alg., 2012] gave an index for jumbled pattern matching for the case of binary alphabets with O( n~2/log~2n )-time construction. They posed as an open problem an efficient solution for larger alphabets. In this paper we provide an index for any constant-sized alphabet. We obtain the first o(n~2 )-space construction of an index with o{n) query time. It can be built in O(n~2) time. Precisely, our data structure can be implemented with O(n~(2-δ)) space and O(m~(2σ-1)δ) query time for any δ > 0, where m is the length of the pattern and σ is the alphabet size (σ = O(1)). We also break the barrier of quadratic construction time for non-binary constant alphabet simultaneously obtaining poly-logarithmic query time.
机译:我们针对非标准字符串学中的索引问题(混杂模式匹配)引入了有效的数据结构。穆萨(Moosa)和拉赫曼(Rahman)[J. Discr。 [Alg。,2012]给出了使用O(n〜2 / log〜2n)-时间构造的二进制字母情况下混杂模式匹配的索引。他们提出了一个较大的字母的有效解决方案,这是一个开放的问题。在本文中,我们为任何恒定大小的字母提供了索引。我们使用o {n)查询时间获得索引的第一个o(n〜2)-空间构造。它可以在O(n〜2)时间内构建。精确地,对于任何δ> 0,我们的数据结构都可以使用O(n〜(2-δ))空间和O(m〜(2σ-1)δ)查询时间来实现,其中m是模式的长度,而σ是字母大小(σ= O(1))。我们还打破了非二进制常量字母的二次构造时间的障碍,同时获得了多对数查询时间。

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