犬细小病毒VP2基因的克隆与生物信息学分析

摘要

本研究以犬细小病毒(Canine parvovirus，CPV)阳性病犬血清中的CPV基因组DNA为模板，成功克隆出CPV-VP2基因，并对其进行生物学分析。测序结果表明，CPV-VP2完整的开放阅读框大小为1755 bp，共编码585个氨基酸残基。CPV-VP2基因与浣熊(M24005)的VP2基因同源性最高，水貂(FJ712219)和猫(M10824)的居中，与猪、奶牛、牛、鼠、鹅、鸡、人和松鼠的VP2丛因同源性较低：CPV-VP2蛋白质中无信号肽;大多数氨基酸偏好以T、A结尾的密码子：CPV-VP2蛋白可能存在7个糖基化位点，其丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别存在8、10、7个磷酸化位点，可能存存76个抗原表位。预测CPV-VP2蛋白为亲水性蛋白，无跨膜结构。预测到CPV-VP2蛋白的二级结构的α-螺旋区域占9．93％、β-折叠区域占24．49％、无规则卷曲区域占65．58％，三级结构存在多个螺旋和折叠区域，主要以无规则卷曲为主。三研究为CPV-VP2在原核或真核中的高效表达提供参考，并为制备CPV胶体金快速诊断试纸条和基因工程疫苗提供有益借鉴。