一株鹅细小病毒全基因特征分析

摘要

本研究根据GenBank登陆的鹅细小病毒基因序列和基因组结构特征，采用PCR技术扩增获得一株鹅细小病毒株(GoPV)全基因序列，为我国大陆地区首次报道。结果表明，GoPV株病毒全基因大小为5106 nt，其基因组5’端和3’端均含有相同的末端倒置重复序列(ITR)，ITR全长为444 nt。其基因组主要由左右两侧两个开放阅读框组成，左侧编码非结构蛋白(NS1和NS2)，右侧编码三种结构蛋白(VP1、VP2和VP3)。非结构蛋白(NS)全长为1884 nt(537～2420)，其中Ns2全长1356 nt(1065～2420);结构基因(VP)全长2199nt(2439～4637)，其中VP2全长1764 nt(2874～4637)，VP3全长1605 nt(3033～4637nt)，在其右侧的ITR前有一个Poly(A)的尾。GoPV株病毒全基因和欧洲疫苗株(EU583392(VG32／1，Europe))核苷酸同源性最高，高达98．6％。本研究为进一步研究GPV分类地位以及进化关系提供依据，也为研究GPV强毒株和疫苗株之间生物学特性、为研究GPV治病机理和开发基因工程疫苗奠定基础。