一株基因Ⅶb亚型新城疫病毒F和HN基因的序列分析

摘要

本研究从2010年佛山市三水区某养殖户送检的鹅病料中分离鉴定出一株新城疫病毒，暂命名Goose/Foshan/2010。运用RT-PCR方法扩增出该病毒的F和HN基因的ORF序列，并进行序列测定。经序列对比、进化分析发现，Goose/Foshan/2010株属于基因Ⅶb亚型毒株，F蛋白裂解位点序列为112R-R-Q-K-R-F117，HN蛋白长度为571，具有强毒株分子特征。对F和HN蛋白分析发现，其HN蛋白第347位抗原位点由E突变为D，第495位抗原位点由K突变为E，此外，HN蛋白缺失了538～540位的糖基化位点。该毒株与秘鲁及马来西亚早期基因Ⅶb亚型分离株进化关系密切，且为我国首次报导的鹅源基因Ⅶb亚型毒株，说明我国目前新城疫的流行情况十分复杂。