16株H9N2亚型禽流感病毒基因组的遗传进化分析

摘要

2009-2011年从江苏、湖北和安徽等地来源于鸡、鸭、鹌鹑和鸽子的样品中分离鉴定出16株H9N2亚型禽流感病毒(AIV)。通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出分离株的全基因片段，并对其进行测序及遗传进化分析。序列分析显示：16株病毒HA基因裂解位点氨基酸序列为P-S-R/K-S-S-R，符合低致病性禽流感的分子特征;16株病毒HA基因在226位均为L，具有与哺乳动物唾液酸α,2-6受体结合的特性；M基因均出现了对金刚烷胺产生耐药性的N31S突变；不同宿主来源的H9亚型AIV的主要分子特征一致。全基因遗传进化分析表明16株H9N2亚型禽流感病毒全基因发生了3配体重组，即以F98亚系AIV为骨架，HA来源于Y280亚系，PB2和M基因来源于G1亚系，形成了2种新的基因型。从不同宿主中分离的H9N2亚型AIV的主要分子特征差异不明显，表明H9N2亚型AIV可在这些不同宿主中交互传播。因此，要加强对H9N2亚型禽流感病毒的监测，密切关注它的重组趋势。