波纹龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析

摘要

采用常规PCR扩增法及保守引物步移法测定了波纹龙虾的线粒体基因组全序列.波纹龙虾的线粒体基因组全长15665 bp,全序列有具有较高的AT偏向性,AT的含量为67％,其中A的含量最高,C的含量最低.9个编码蛋白基因(ATP6,ATP8,CO2,CO3,Cob,NDM,ND4L和ND5)的起始密码子是ATG,ND2起始于GTG,ND3和ND6为ATC,COI的起始密码子是ACG.除ATP6、ATP8、CO3、ND1、ND2、ND4L和ND6的终止密码子是TAA外,其余的编码蛋白基因的终止密码子为不完全的T或TA.tRNASer缺少D臂,有4个(tRNALeu-UUR、tRNAArg、tRNAASAsn、tRNAIle、tRNArp)基因变异比较大,无法采用常规算法预测出来.IrRNA的二级结构含有4个结构域,53个茎环结构,srRNA的二级结构含有3个结构域,40个茎环结构.A+T富集区包含复制相关的调控信息,存在Ploy(T)结构,与复制及转录起始有关.