转录组分析表明细胞分裂和生长素相关基因在毛竹笋快速生长过程中起着重要作用

摘要

作为具有极高经济价值,生态价值和文化价值的中国最重要的经济竹种,毛竹是世界上生长速度最快的物种之一.其奇特的笋竹生长发育特征备受研究者关注.本研究利用de novo转录组测序技术对毛竹笋发育的内在调控机制作了深入研究.结果,对毛竹快速生长过程中不同时期的混合样和成熟茎秆通过Illumina HiSeqTM2000测序平台转录测序分别获得65,045,670和68,431,884的clean reads.差异表达分析共获得6,076条上调表达的基因和4,613条下调表达的基因.差异表达基因按照功能划分至细胞代谢,细胞运输,信号转导以及抗虫反应等多个类别中,分别涉及细胞壁代谢,碳代谢,氮代谢和信号转导等功能类别.其中植物激素相关基因1154个,占据差异表达基因总量的11％.结论,本研究对毛竹笋快速生长过程中的分子调控机制展开研究,为毛竹快速生长的后续研究提供生物信息学基础.