基于高分辨率熔解曲线的桃SNP基因分型

摘要

作物中,SNP标记具有分布广泛、分辨率高、共显性和多态性高等特点.桃全基因组测序的完成,获得了大量的SNPs.简单、快速的SNP基因分型是开展后续研究的基础,因此,本研究拟建立采用高分辨率熔解曲线进行不同SNP的基因分型方法.以半矮生性状杂交后代的分离群体为研究材料,在定位目标基因的区间内开发连锁和不同类型的SNP标记的基础上,采用高分辨率熔解曲线进行SNP的基因分型.明确了DNA模板和Mg2+是影响基因分型的关键因子;HRM分析可对由单个核苷酸变异引起的4种不同的SNP进行基因分型,并正确区分了半矮生型和普通生长型.建立了基于HRM的SNP基因分型,该体系可用于桃的基因定位、遗传多样性和品种鉴定等研究中.