结合支持向量机和分子对接的方法虚拟筛选IMP-1型金属-β-内酰胺酶抑制剂

摘要

目的:金属-β-内酰胺酶能够广泛水解β-内酰胺类抗生素,目前临床上尚无针对其有效的抑制剂.因此,近年来金属-β-内酰胺酶抑制剂的开发受到重视.方法:本论文结合支持向量机(SVM)和对接的方法虚拟筛选IMP-1型金属-β-内酰胺酶抑制剂.在SVM建模中,采用逐步筛选描述符(SDS)的方法实现描述符的自动筛选.这种结合SVM和对接的筛选方法极大的提高了命中率和筛选速度,节省了计算资源.结果:用建好的模型虚拟筛选组合化合物数据库,命中25个化合物,购买8个用来做体外活性测试.其中有4个化合物对IMP-1的抑制活性值IC50在微摩尔级水平.这4个活性化合物中,有两个化合物具有全新的骨架结构,可进一步改造优化.结论:结合SVM和对接方法进行虚拟筛选可用于高效开发金属-β-内酰胺酶抑制剂.