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猫细小病毒HH-1/86株理化性质鉴定及全基因组测序

摘要

本实验对HH-1/86株细小病毒进行了理化性质鉴定和全基因组序列分析.研究结果表明,电镜下可见少量直径20nm左右的立体对称细小病毒粒子.该病毒对热、酸、乙醚具有一定的耐受性,pH在5.8~6.8的0.015M PBS均能凝集0.1%猪红细胞,其中pH6.5血凝活性最佳.HH-1/86株细小病毒的全基因长5123nt.其中,A+T含量63.65%,C+G的含量为36.35%.3'末端反向重复序列(Inverted Terminal Repeats,ITR)形成Y型结构,长126nt;5'末端ITR形成U型结构,长198nt.利用MEGA6.0软件的邻接法(Neighbor-Joining,Replication=1000)对NS1和VP2基因编码氨基酸进行的种系发生树分析表明,VP2蛋白归于FPV分支,VP2蛋白10个决定抗原性、血凝性和宿主范围的关键氨基酸位点与FPV参照株一致;而NS1蛋白相对保守,归于独立的分支.

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