2016年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5和Nsp2基因克隆与序列分析

摘要

本研究用RT-PCR方法成功克隆了9株PRRSV的Nsp2高变区基因片段与22株PRRSV的ORF5基因片段.研究表明,9株PRRSV分离株的Nsp2核苷酸同源性为77.2％～99.7％,与VR-2332的核苷酸同源性为76.6％～99.2％,与国内经典株CH-la、国内高致病性代表株TJ、JXA1核苷酸同源性分别为83.1％～90.7％,80.6％～98.2％、81.0％～98.9％,与VR-2332相比,除分离株GXNN1604b外,其他8株分离的PRRSV Nsp2基因编码的氨基酸均存在1+29个氨基酸缺失(第82位缺失laa,第138-166位缺失29aa),这与JXA1为代表的国内HP-PRRSV相同.22株分离株ORF5基因核苷酸同源性为88.1％～100％,与VR-2332、CH1-a、JXA1、TJ核苷酸同源性分别为88.1％～99.5％、91.5％～95.4％、88.7％～99.7％、88.9％～99.7％.遗传进化树结果表明,本研究的31株毒株均属于美洲型毒株,与HP-PRRSV代表毒株处于同一个分支,具有与国内其他变异毒株一致的基因特征,说明2016年广西PRRSV主要流行的毒株多为变异性毒株.