缢蛏Amy A基因克隆、序列分析及组织表达特征分析

摘要

为研究AmyA基因的结构、功能及在缢蛏生长、发育过程中的调控作用,本实验利用SMARTRACE方法首次克隆得到缢蛏Amy(Sc-Amy A)基因的cDNA全长序列,对其生物信息学及氨基酸序列特征进行了研究分析.结果发现Sc-Amy A基因全长为2196bp,该基因的开放阅读框为2082bp,编码694个氨基酸,蛋白存在信号肽,没有明显的跨膜区域,是一个亲水性较强的蛋白.蛋白由A结构域和C结构域两个结构域组成;氨基酸序列对比发现,Sc-Amy A与河蚬的同源性最高,为78.6％.荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,Sc-Amy A基因仅在内脏团中表达.