枳壳EST-SSR标记的开发

摘要

GeneBank上公布的枳壳EST序列为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源.本研究利用在线SSR鉴定软件SSRIT分析来自枳壳EST数据库的11029条Uni-gene序列,共发现327条EST序列含有348个SSR位点,占总数的2.96％.其中,三核苷酸重复的SSR类型最多,共有161个,占检索总数的46.26％.Primer 3.0设计合成58对引物,其中36对能扩增出产物,6对引物产生多态性分离,分别占所设计引物总数的62.07％和10.34％.本文研究成果为今后枳壳遗传多样性分析、遗传图谱构建及比较基因组等研究方面奠定了基础.